prikaz prve stranice dokumenta Diferencijalna ekspresija varijanti alternativnog prekrajanja uročnjakova gena BPM2 u uvjetima temperaturnog stresa
  Preuzmi
PDF 3.54 MB
diplomski rad
Diferencijalna ekspresija varijanti alternativnog prekrajanja uročnjakova gena BPM2 u uvjetima temperaturnog stresa
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2024. urn:nbn:hr:217:483467
Frlin, Marta
Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Biološki odsjek

Institucijski repozitorij: Repozitorij Prirodoslovno-matematičkog fakulteta

Citirajte ovaj rad

Frlin, M. (2024). Diferencijalna ekspresija varijanti alternativnog prekrajanja uročnjakova gena BPM2 u uvjetima temperaturnog stresa (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:483467

Frlin, Marta. "Diferencijalna ekspresija varijanti alternativnog prekrajanja uročnjakova gena BPM2 u uvjetima temperaturnog stresa." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2024. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:483467

Frlin, Marta. "Diferencijalna ekspresija varijanti alternativnog prekrajanja uročnjakova gena BPM2 u uvjetima temperaturnog stresa." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2024. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:483467

Frlin, M. (2024). 'Diferencijalna ekspresija varijanti alternativnog prekrajanja uročnjakova gena BPM2 u uvjetima temperaturnog stresa', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 26.12.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:483467

Frlin M. Diferencijalna ekspresija varijanti alternativnog prekrajanja uročnjakova gena BPM2 u uvjetima temperaturnog stresa [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2024 [pristupljeno 26.12.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:483467

M. Frlin, "Diferencijalna ekspresija varijanti alternativnog prekrajanja uročnjakova gena BPM2 u uvjetima temperaturnog stresa", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2024. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:483467

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:483467
Podaci o radu
NaslovDiferencijalna ekspresija varijanti alternativnog prekrajanja uročnjakova gena BPM2 u uvjetima temperaturnog stresa
Naslov (engleski)Differential expression of arabidopsis BPM2 gene splicing variants in response to temperature stress
AutorMarta Frlin
MentorDunja Leljak-Levanić (mentor)
MentorMateja Jagić (komentor)
Član povjerenstvaDunja Leljak-Levanić (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaNataša Bauer (član povjerenstva)
Član povjerenstvaŽeljka Vidaković-Cifrek (član povjerenstva)
Član povjerenstvaMirjana Pavlica (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Biološki odsjek)
Zagreb
Datum i država obrane2024-07-17, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Biologija
Sažetak
Proteini MATH-BTB sudjeluju u proteasomalnoj razgradnji proteina ovisnoj o ubikvitinu kao adaptori ligaza E3 ovisnih o kulinu 3 i odgovorni su za specifičnost prema supstratu. Na ovaj način proteini MATH-BTB reguliraju i biljni odgovor na temperaturni stres. Dok je ova porodica u genomu uročnjaka Arabidopsis thaliana zastupljena sa samo šest gena BPM1-6, genomi različitih vrsta trava sadrže desetke gena uslijed vrsno-specifične ekspanzije. Ovaj fenomen najčešće se povezuje s porodicama proteina uključenim u odgovor na stresne uvjete u okolišu. U ovom radu provedena je in silico analiza promotorske regije gena BPM2 te su utvrđeni regulatorni elementi. Metodama standardne i kvantitativne lančane reakcije polimerazom analizirana je ekspresija odabranih varijanti alternativnog prekrajanja gena BPM2 u klijancima, cvjetnim pupovima i oplođenim cvjetovima biljaka izloženih niskim ili povišenim temperaturama. Na ovaj način je istražen utjecaj temperaturnog stresa na zastupljenost varijanti alternativnog prekrajanja gena BPM2, ali i potencijalna uloga alternativnog prekrajanja kao mehanizma kompenzacije smanjenog broja gena porodice MATH-BTB u uročnjaku. Temperaturni tretman utjecao je na zastupljenost i razinu ekspresije varijanti alternativnog prekrajanja BPM2.3, BPM2.8, BPM2.9 i BPM2.15. Razlike su bile najizraženije u klijancima. Detektirane su i neočekivane, potencijalno nove varijante alternativnog prekrajanja gena BPM2.
Sažetak (engleski)
MATH-BTB proteins participate in ubiquitin-dependent protein degradation as substrate-specific adaptors of cullin3-dependent E3 ligases. Through this mechanism they are involved in the regulation of plant response to temperature stress. Only six genes from this family are present in Arabidopsis thaliana genome (BPM1-6), while genomes of different grass species contain dozens of them due to lineage-specific expansion. Many protein families which underwent lineage-specific expansion are involved in response to environmental stress. In this thesis, an in silico analysis of BPM2 gene promoter region was performed. The expression of selected BPM2 gene splicing variants was analysed in seedlings, flower buds and flowers of plants exposed to low or elevated temperature by standard and quantitative polymerase chain reactions. Using these methods, the effect of temperature stress on the expression of BPM2 gene splicing variants was studied. The role of alternative splicing as a compensatory mechanism for the presence of only six BPM genes in arabidopsis genome was investigated. Temperature stress affected the expression of BPM2.3, BPM2.8, BPM2.9 and BPM2.15 splicing variants. The differences were the most pronounced in seedlings. Unexpected, potentially new BPM2 gene splicing variants were also detected.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:217:483467
ProjektŠifra: IP-2022-10-7874
Naziv: Alternativno prekrajanje gena BPM2 kao mehanizam uspostave funkcionalne raznolikosti porodice proteina MATH-BTB u uročnjaku Arabidopsis thaliana
Naziv: Alternative splicing of BPM2 as a mechanism for establishing a functional diversity of MATH-BTB protein family in Arabidopsis thaliana
Kratica: SpliceFun
Voditelj: Nataša Bauer
Pravna nadležnost: Hrvatska
Financijer: Hrvatska zaklada za znanost
Linija financiranja: Research Projects
Studijski programNaziv: Molekularna biologija
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: sveučilišni/a magistar/magistra molekularne biologije (univ. mag. biol. mol.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaOtvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2024-08-26 12:19:04