prikaz prve stranice dokumenta Seasonal and spatial distribution of antibiotic resistance in marine microbial communities along a trophic gradient in central Adriatic Sea
  Preuzmi
PDF 25.57 MB
doktorski rad
Seasonal and spatial distribution of antibiotic resistance in marine microbial communities along a trophic gradient in central Adriatic Sea
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2024. urn:nbn:hr:217:788157
Dželalija, Mia
Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Biološki odsjek

Institucijski repozitorij: Repozitorij Prirodoslovno-matematičkog fakulteta

Citirajte ovaj rad

Dželalija, M. (2024). Seasonal and spatial distribution of antibiotic resistance in marine microbial communities along a trophic gradient in central Adriatic Sea (Doktorski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:788157

Dželalija, Mia. "Seasonal and spatial distribution of antibiotic resistance in marine microbial communities along a trophic gradient in central Adriatic Sea." Doktorski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2024. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:788157

Dželalija, Mia. "Seasonal and spatial distribution of antibiotic resistance in marine microbial communities along a trophic gradient in central Adriatic Sea." Doktorski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2024. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:788157

Dželalija, M. (2024). 'Seasonal and spatial distribution of antibiotic resistance in marine microbial communities along a trophic gradient in central Adriatic Sea', Doktorski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 10.09.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:788157

Dželalija M. Seasonal and spatial distribution of antibiotic resistance in marine microbial communities along a trophic gradient in central Adriatic Sea [Doktorski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2024 [pristupljeno 10.09.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:788157

M. Dželalija, "Seasonal and spatial distribution of antibiotic resistance in marine microbial communities along a trophic gradient in central Adriatic Sea", Doktorski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2024. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:788157

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:788157
Podaci o radu
NaslovSeasonal and spatial distribution of antibiotic resistance in marine microbial communities along a trophic gradient in central Adriatic Sea
Naslov (hrvatski)Sezonska i prostorna raspodjela rezistencije na antibiotike u morskim mikrobnim zajednicama duž trofičkog gradijenta u srednjem Jadranu
AutorMia Dželalija
MentorAna Maravić (mentor)
Član povjerenstvaMartina Šeruga Musić (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaMirna Mrkonjić Fuka (član povjerenstva)
Član povjerenstvaAna Bielen (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Biološki odsjek)
Zagreb
Datum i država obrane2024-07-15, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Biologija
Univerzalna decimalna klasifikacija
(UDC)		57 - Biološke znanosti. Fizička antropologija. Bioraznolikost
Sažetak
Marine and ocean environments are the most widespread habitats in the world but are still among the least studied from the aspect of antibiotic resistance (AR). The aim was to investigate the seasonal and spatial features of AR in microbial communities along trophic gradient of central Adriatic encompassing a 68-km transect from wastewater-impacted estuary to coastal and pristine open sea. Eighty microbiomes were profiled by using Illumina-based 16S rRNA amplicon sequencing revealing that biogeographical shifts in microbial community are largely driven by the seasonality, featured by thermohaline stratification and nutrients in particular. Proteobacteria were the predominant along the gradient and major contributors to the marine resistomes. Targeted resistance genes were quantified using RT-qPCR, among which distribution of tetA, blaCTX-M and blaTEM correlated with higher temperature, nutrient load and lower salinity. WHO 'high' and 'critical priority' pathogens including vancomycin-resistant Enterococcus faecium and carbapenemase-producing Enterobacteriaceae were isolated from wastewater-impacted coastal waters, pointing to their sewage-driven dissemination in marine environment. Enterobacteriaceae carried carbapenemase genes (blaKPC-2, blaOXA-48 and blaVIM- 1) on diverse conjugative plasmids favouring their horizontal spread as revealed by conjugation experiments and de novo plasmid sequencing. These results show a complex pattern of AR persisting along the trophic gradient and an importance of anthropogenic influence on its dissemination in marine ecosystems, accentuating the imperative for comprehensive strategies congruent with the One Health paradigm to combat AR in the environment.
Sažetak (hrvatski)
Mora i oceani su najrasprostranjeniji prirodni ekosustavi na Zemlji, a ipak su među najmanje istraženima s aspekta antibiotske rezistencije (AR). Cilj je bio istražiti sezonske i prostorne značajke AR u mikrobnim zajednicama duž trofičkog gradijenta srednjeg Jadrana duž 68 km od estuarija pod utjecajem otpadnih voda do obalnog i otvorenog mora. Osamdeset mikrobioma profilirano je korištenjem 16S rRNA sekvenciranja, otkrivajući da su biogeografski pomaci u mikrobnoj zajednici uvelike potaknuti sezonskim promjenama, osobito termohalinom stratifikacijom i hranjivim tvarima. Proteobakterije su prevladavale duž gradijenta i bile glavni čimbenici morskog rezistoma. Ciljani geni AR kvantificirani su pomoću RT-qPCR, pri čemu je distribucija tetA, blaCTX-M i blaTEM korelirala sa višom temperaturom, povećanom koncentracijom hranjivih tvari i nižim salinitetom. Patogeni 'visokog' i 'kritičnog prioriteta', uključujući vankomicin-rezistentni Enterococcus faecium i karbapenemaze-producirajuće Enterobacteriaceae izolirani su iz obalnog područja pod utjecajem otpadnih voda, što ukazuje na njihovo širenje u morskom okolišu putem kanalizacije. Izolati enterobakterija nosili su karbapenemaza-kodirajuće gene (blaKPC-2, blaOXA-48 and blaVIM-1) na različitim konjugacijskim plazmidima što pogoduje njihovom horizontalnom širenju, a što je potvrđeno eksperimentima konjugacije i de novo sekvenciranjem plazmida. Ovi rezultati pokazuju složeni obrazac AR duž trofičkog gradijenta i važnost antropogenog utjecaja za njezino širenje u morskim ekosustavima te nužnost sveobuhvatnih strategija usklađenih s paradigmom „Jednog zdravlja“ (eng. One health) radi rješavanja problema AR u okolišu.
Ključne riječi
Ključne riječi (hrvatski)
Jezikengleski
URN:NBNurn:nbn:hr:217:788157
Datum promocije2024
ProjektŠifra: UIP-2019-04-9778
Naziv: Sezonska i prostorna raspodjela gena rezistencije na antibiotike u morskim mikrobnim zajednicama duž trofičkog gradijenta u srednjem Jadranu
Naziv: Seasonal and spatial distribution of antibiotic resistance genes in marine microbial communities along a trophic gradient in central Adriatic Sea
Kratica: ARGAS
Voditelj: Ana Maravić
Pravna nadležnost: Hrvatska
Financijer: Hrvatska zaklada za znanost
Linija financiranja: Installation Research Projects
Studijski programNaziv: Biologija
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: doktorski studij
Akademski / stručni naziv: doktor/doktorica znanosti u području prirodnih znanosti (dr. sc. natur.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaOtvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2024-09-03 10:28:22