prikaz prve stranice dokumenta Ekspresija gena uključenih u popravak križnih veza DNA i proteina u zebricama (Danio rerio) koje nose mutaciju u genu tirozil-DNA fosfodiesteraza 2b
  Preuzmi
PDF 3.4 MB
diplomski rad
Ekspresija gena uključenih u popravak križnih veza DNA i proteina u zebricama (Danio rerio) koje nose mutaciju u genu tirozil-DNA fosfodiesteraza 2b
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2024. urn:nbn:hr:217:777029
Radović, Petra
Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Biološki odsjek

Institucijski repozitorij: Repozitorij Prirodoslovno-matematičkog fakulteta

Citirajte ovaj rad

Radović, P. (2024). Ekspresija gena uključenih u popravak križnih veza DNA i proteina u zebricama (Danio rerio) koje nose mutaciju u genu tirozil-DNA fosfodiesteraza 2b (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:777029

Radović, Petra. "Ekspresija gena uključenih u popravak križnih veza DNA i proteina u zebricama (Danio rerio) koje nose mutaciju u genu tirozil-DNA fosfodiesteraza 2b." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2024. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:777029

Radović, Petra. "Ekspresija gena uključenih u popravak križnih veza DNA i proteina u zebricama (Danio rerio) koje nose mutaciju u genu tirozil-DNA fosfodiesteraza 2b." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2024. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:777029

Radović, P. (2024). 'Ekspresija gena uključenih u popravak križnih veza DNA i proteina u zebricama (Danio rerio) koje nose mutaciju u genu tirozil-DNA fosfodiesteraza 2b', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 24.11.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:777029

Radović P. Ekspresija gena uključenih u popravak križnih veza DNA i proteina u zebricama (Danio rerio) koje nose mutaciju u genu tirozil-DNA fosfodiesteraza 2b [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2024 [pristupljeno 24.11.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:777029

P. Radović, "Ekspresija gena uključenih u popravak križnih veza DNA i proteina u zebricama (Danio rerio) koje nose mutaciju u genu tirozil-DNA fosfodiesteraza 2b", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2024. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:777029

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:777029
Podaci o radu
NaslovEkspresija gena uključenih u popravak križnih veza DNA i proteina u zebricama (Danio rerio) koje nose mutaciju u genu tirozil-DNA fosfodiesteraza 2b
Naslov (engleski)Expression of genes involved in DNA-protein crosslink repair in zebrafish (Danio rerio) carrying a mutation in the tyrosyl-DNA phosphodiesterase 2b gene
AutorPetra Radović
MentorCecile Francoise Eleonore Otten (mentor)
MentorIvana Ivančić Baće (komentor)
Član povjerenstvaIvana Ivančić Baće (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaDraginja Mrvoš-Sermek (član povjerenstva)
Član povjerenstvaMirela Sertić Perić (član povjerenstva)
Član povjerenstvaMirta Rubčić (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Biološki odsjek)
Zagreb
Datum i država obrane2024-09-17, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Biologija
Sažetak
Križne veze DNA i proteina (DPC) su oštećenja DNA u kojima su proteini nepovratno križno vezani s DNA. Zbog njihove veličine i kemijske stabilnosti, potrebno ih je ukloniti kako bi se omogućio nastavak bitnih procesa, uključujući replikaciju i transkripciju. Specifični put popravka nazvan DPC popravkom (DPCR) nedavno je otkriven, a način djelovanja nekoliko ključnih enzima proučavan je u uvjetima in vitro i u staničnoj kulturi. Jedan takav enzim je tirozil-DNA fosfodiesteraza 2 (Tdp2), koja sudjeluje u uklanjanju umrežene topoizomeraze 2 iz DNA. Osim proteaza i nukleaza, za potpuni popravak DPC oštećenja vjerojatno su potrebni i drugi pomoćni proteini. Za proučavanje potencijalnih interakcija između produkta gena tdp2 i popravka DPCR in vivo, upotrijebila sam zebricu Danio rerio, koja je dobro okarakteriziran mali kralježnjak koji se rutinski koristi kao životinjski model. U ovom radu istražila sam promjene ekspresije gena u mutantu tdp2b zebrice, dominantnog ortologa odgovornog za većinu aktivnosti Tdp2 u embrijima zebrice. Od svih analiziranih gena, analiza ekspresije otkrila je značajno smanjenu ekspresiju znf451 i mre11a, te pojačanu regulaciju gena acrc što bi moglo ukazivati na potencijalnu međuovisnost s genom tdp2b kod zebrica.
Sažetak (engleski)
DNA-Protein Crosslinks (DPCs) are DNA lesions in which proteins are irreversibly crosslinked to DNA. Due to their size and chemical stability, they need to be removed to enable essential processes including replication and transcription to proceed. A specific repair pathway termed DPC repair (DPCR) has recently been uncovered and the mode of action of several key enzymes has been studied in vitro and in cell culture. One such enzyme is the tyrosyl-DNA phosphodiesterase 2 (Tdp2), which is involved in the removal of cross-linked Topoisomerase 2 from DNA. However, proteases, nucleases and other accessory proteins are likely required for the complete repair of DPC lesions. To study the potential interactions between tdp2 gene product and DPCR in vivo, I used the zebrafish Danio rerio, which is a well-characterized small vertebrate that is routinely used as an animal model. In this work, I investigated gene expression changes in the tdp2b zebrafish mutant, of the more dominantly expressed orthologue that accounts for the majority of Tdp2 activity in zebrafish embryos. Out of all analysed genes, expression analysis revealed significantly reduced expression of znf451 and mre11a, and upregulation of acrc gene that could indicate potential interdependency with tdp2b gene in zebrafish.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikengleski
URN:NBNurn:nbn:hr:217:777029
Studijski programNaziv: Biologija i kemija; smjerovi: nastavnički
Smjer: nastavnički
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: integrirani preddiplomski i diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/magistra edukacije biologije i kemije (mag. educ. biol. et chem.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaOtvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2024-09-22 11:03:46