prikaz prve stranice dokumenta Struktura i ekspresija gena za proteine Rad51 i Rad51D iz morske spužve Suberites domuncula
  Preuzmi
PDF 775.46 KB
diplomski rad
Struktura i ekspresija gena za proteine Rad51 i Rad51D iz morske spužve Suberites domuncula
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2009. urn:nbn:hr:217:933768
Šimatović, Ana
Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Biološki odsjek

Institucijski repozitorij: Repozitorij Prirodoslovno-matematičkog fakulteta

Citirajte ovaj rad

Šimatović, A. (2009). Struktura i ekspresija gena za proteine Rad51 i Rad51D iz morske spužve Suberites domuncula (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:933768

Šimatović, Ana. "Struktura i ekspresija gena za proteine Rad51 i Rad51D iz morske spužve Suberites domuncula." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2009. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:933768

Šimatović, Ana. "Struktura i ekspresija gena za proteine Rad51 i Rad51D iz morske spužve Suberites domuncula." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2009. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:933768

Šimatović, A. (2009). 'Struktura i ekspresija gena za proteine Rad51 i Rad51D iz morske spužve Suberites domuncula', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 18.12.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:933768

Šimatović A. Struktura i ekspresija gena za proteine Rad51 i Rad51D iz morske spužve Suberites domuncula [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2009 [pristupljeno 18.12.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:933768

A. Šimatović, "Struktura i ekspresija gena za proteine Rad51 i Rad51D iz morske spužve Suberites domuncula", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2009. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:933768

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:933768
Podaci o radu
NaslovStruktura i ekspresija gena za proteine Rad51 i Rad51D iz morske spužve Suberites domuncula
Naslov (engleski)Structure and expression of genes for proteins Rad51 and Rad51D from marine sponge Suberites domuncula
AutorAna Šimatović
MentorHelena Ćetković (mentor)
Član povjerenstvaMirjana Kalafatić (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaMaja Matulić (član povjerenstva)
Član povjerenstvaŽeljka Vidaković Cifrek (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Biološki odsjek)
Zagreb
Datum i država obrane2009, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Biologija
Sažetak
Proteini od interesa, Rad51 i Rad51D, imaju vrlo važnu ulogu kod sisavaca u održavanju integriteta genoma. Postojanje ovih proteina utvrđeno je i kod drugih kralježnjaka, te kod beskralježnjaka. Modelni organizam, morska spužva Suberites domuncula pripada koljenu Porifera, najstarijim danas živućim mnogostaničnim organizmima, i stoga je vrlo zanimljiva za istraživanje evolucijski sačuvanih gena/proteina. Metodama umnožavanja DNA lančanom reakcijom polimeraze i određivanja slijeda nukleotida u molekuli DNA Sangerovom dideoksi metodom utvrđen je nukleotidni slijed gena rad51 i rad51D te položaj introna. Pomoću algoritma BLAST i programa Clustal X i GeneDoc uspoređene su dobivene proteinske sekvence s njihovim ortolozima u drugim organizmima. Proteinske sekvence i položaj introna očekivano pokazuju veću homologiju s ortolozima iz kralježnjaka, nego iz beskralježnjaka. Gen rad51D ukloniran je u ekspresijski vektor kojim su transformirane stanice BL21. Nedovoljna koncentracija proteina se zadržava u topljivoj fazi, većina odlazi u talog gdje se agregira u obliku inkluzijskih tijela.
Sažetak (engleski)
The proteins of interest, Rad51 and Rad51D play a very important part in maintaining mammalian genome integrity. The existence of these proteins was detected in other vertebrates, as well as in invertebrates. The model organism, marine sponge Suberites domuncula belongs to the phylum Porifera, the oldest living Metazoa. Therefore, the study of its genes/proteins that have been conserved through evolution is very interesting. Polymerase chaine reaction for multiplying DNA and Sanger dideoxynucleotide sequencing method were used in order to determine the nucleotide sequence for genes rad51 and rad51D and their intron position. Using BLAST searches of GenBank database and Clustal X and GeneDoc programmes, the obtained protein sequences were compared to their orthologs in other organisms. As expected, the protein sequences and intron position show more homology with their vertebrate orthologs than with their invertebrate orthologs. The rad51D gene was cloned into the expression vector which was used to transform BL21 cells. Insufficient protein concentration is contained in the supernatant, due to the fact that most proteins sediment and aggregate to form inclusion bodies.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:217:933768
Studijski programNaziv: Diplomirani inženjer biologije; smjerovi: Molekularna biologija
Smjer: Molekularna biologija
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: dodiplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/magistra biologije (mag. biol.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaOtvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2018-03-21 09:33:37