prikaz prve stranice dokumenta Raznolikost virusa Cryphonectria hypovirus 1 na području Kašta
  Preuzmi
PDF 2.29 MB
diplomski rad
Raznolikost virusa Cryphonectria hypovirus 1 na području Kašta
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2018. urn:nbn:hr:217:476012
Pavičić, Ivana
Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Biološki odsjek

Institucijski repozitorij: Repozitorij Prirodoslovno-matematičkog fakulteta

Citirajte ovaj rad

Pavičić, I. (2018). Raznolikost virusa Cryphonectria hypovirus 1 na području Kašta (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:476012

Pavičić, Ivana. "Raznolikost virusa Cryphonectria hypovirus 1 na području Kašta." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2018. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:476012

Pavičić, Ivana. "Raznolikost virusa Cryphonectria hypovirus 1 na području Kašta." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2018. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:476012

Pavičić, I. (2018). 'Raznolikost virusa Cryphonectria hypovirus 1 na području Kašta', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 18.12.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:476012

Pavičić I. Raznolikost virusa Cryphonectria hypovirus 1 na području Kašta [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2018 [pristupljeno 18.12.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:476012

I. Pavičić, "Raznolikost virusa Cryphonectria hypovirus 1 na području Kašta", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2018. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:476012

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:476012
Podaci o radu
NaslovRaznolikost virusa Cryphonectria hypovirus 1 na području Kašta
Naslov (engleski)Diversity of Cryphonectria hypovirus 1 in Kašt area
AutorIvana Pavičić
MentorMirna Ćurković Perica (mentor)
MentorLucija Nuskern Karaica (pomoć pri izradi, neposredni voditelj)
Član povjerenstvaMarin Ježić (član povjerenstva)
Član povjerenstvaNada Oršolić (član povjerenstva)
Član povjerenstvaPetar Kružić (član povjerenstva)
Član povjerenstvaMaja Matulić (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Biološki odsjek)
Zagreb
Datum i država obrane2018-02-23, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Biologija
Sažetak
Gljiva mješinarka Cryphonectria parasitica uzročnik je raka kore pitomoga kestena (Castanea sativa). Virus Cryphonectria hypovirus 1 (CHV1) inficira gljivu C. parasitica te smanjuje njezinu virulenciju, fenomen koji nazivamo hipovirulencija te tako omogućava prirodnu biološku kontrolu raka kore pitomoga kestena. Vrsta CHV1 najbolje je do sada proučena vrsta hipovirusa i jedina prisutna u Europi, gdje postoje četiri podtipa ovog virusa. Prisutnost virusa dokazana je izolacijom virusne dsRNA, reverznom transkripcijom te amplifikacijom otvorenog okvira čitanja ORF A. Nakon sekvenciranja umnoženih fragmenata dobivene su djelomične sekvence ORF A duljine 1134 nukleotida, te su izrađena filogenijska stabla. Prevalencija virusa CHV1 na području Kašta iznosila je 50 %. Virusni sojevi s područja Kašta pripadaju istom, talijanskom podtipu, vrlo su srodni sojevima iz Slovenije, Italije i Švicarske, a manje srodni sojevima iz Španjolske, Njemačke i Francuske. Virusni sojevi s područja Kašta pripadaju genski vrlo srodnoj populaciji virusa, te se značajno ne razlikuju od starih sojeva izoliranih na području Hrvatske i Slovenije.
Sažetak (engleski)
Sac fungus Cryphonectria parasitica is a causal agent of chestnut blight, a disease of sweet chestnut (Castanea sativa). Cryphonectria hypovirus 1 (CHV1) is a natural biocontrol agent of chestnut blight: it infects C. parasitica and reduces its virulence towards chestnut. This phenomenon is called hypovirulence. CHV1 is the best studied species of hypoviruses and the only one present in Europe, where four subtypes of this virus have been identified. CHV1 presence was determined by isolation of viral dsRNA, reverse transcription and amplification of open reading frame (ORF A). After sequencing of amplified fragments, partial ORF A sequences 1134 mucleotides long were obtained and phylogenetic trees constructed. The prevalence of CHV1 in Kašt was 50 %. All virus strains from Kašt are of the same, Italian subtype, and are closely related to strains from Slovenia, Italy and Switzerland, while they are more distantly related to strains from Spain, Germany and France. Virus strains from Kašt form genetically very similar population and they do not differ significantly from the old strains isolated in Croatia and Slovenia.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:217:476012
Studijski programNaziv: Molekularna biologija
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/magistra molekularne biologije (mag. biol. mol.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaOtvoreni pristup
Datum isteka embarga: 2020-02-23
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2018-05-04 10:56:14