prikaz prve stranice dokumenta Istraživanje interakcija cijaninskih boja s polinukleotidima spektroskopskim i termoanalitičkim metodama
  Preuzmi
PDF 3.12 MB
disertacija
Istraživanje interakcija cijaninskih boja s polinukleotidima spektroskopskim i termoanalitičkim metodama
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2018. urn:nbn:hr:217:721510
Rožman, Andrea
Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Kemijski odsjek

Institucijski repozitorij: Repozitorij Prirodoslovno-matematičkog fakulteta

Citirajte ovaj rad

Rožman, A. (2018). Istraživanje interakcija cijaninskih boja s polinukleotidima spektroskopskim i termoanalitičkim metodama (Disertacija). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:721510

Rožman, Andrea. "Istraživanje interakcija cijaninskih boja s polinukleotidima spektroskopskim i termoanalitičkim metodama." Disertacija, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2018. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:721510

Rožman, Andrea. "Istraživanje interakcija cijaninskih boja s polinukleotidima spektroskopskim i termoanalitičkim metodama." Disertacija, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2018. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:721510

Rožman, A. (2018). 'Istraživanje interakcija cijaninskih boja s polinukleotidima spektroskopskim i termoanalitičkim metodama', Disertacija, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 21.11.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:721510

Rožman A. Istraživanje interakcija cijaninskih boja s polinukleotidima spektroskopskim i termoanalitičkim metodama [Disertacija]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2018 [pristupljeno 21.11.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:721510

A. Rožman, "Istraživanje interakcija cijaninskih boja s polinukleotidima spektroskopskim i termoanalitičkim metodama", Disertacija, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2018. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:721510

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:721510
Podaci o radu
NaslovIstraživanje interakcija cijaninskih boja s polinukleotidima spektroskopskim i termoanalitičkim metodama
Naslov (engleski)Study of cyanine dyes interactions with polynucleotides using spectroscopic and thermoanalytical methods of analyses
AutorAndrea Rožman
MentorIvo Piantanida (mentor)
Član povjerenstvaVladislav Tomišić (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaSnežana Miljanić (član povjerenstva)
Član povjerenstvaIvo Piantanida (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Kemijski odsjek)
Zagreb
Datum i država obrane2018-12-13, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Kemija
Univerzalna decimalna klasifikacija
(UDC)		54 - Kemija. Kristalografija. Mineralogija
Sažetak
Uvođenje klora kao substituenta na cijaninski kromofor dobro poznatih cijaninskih boja TOTO i YOYO, koje se koriste za bojanje i vizualizaciju DNA, rezultirao je značajnim promjenama u molekulskom prepoznavanju različitih DNA i RNA u usporedbi s ishodnim bojama, a isto tako i u odnosu na odgovarajuće monomere 6-Cl-TO-1 i 6-Cl-YO-1. Istraživani novi spojevi tvore nekovalentne komplekse s dvolančanim DNA/RNA, vrlo visoke stabilnosti, Ks > 107 dm3 mol−1, s malim razlikama u konstantama stabilnosti reakcije vezanja između različitih sljedova DNA/RNA. Spoj 6-Cl-YOYO-1 je pokazao specifično fluorimetrijsko prepoznavanje ds-RNA karakterističnom emisijom na 570 nm, koja se ne pojavljuje dodatkom bilo koje ds-DNA. Navedena specifična emisija (570 nm) pripisuje se svojstvu agregacije 6-Cl-YOYO-1 boje, te stoga nije prisutna kod analogne boje 6-Cl-TOTO-1. 6-Cl-TOTO-1 je za razliku od YO analoga, pokazao vrpcu induciranog cirkularnog dikroizma (ICD) pri 520 nm samo prilikom vezanja na alternirajuće DNA sekvence (GC-GC i AT-AT), što nije primijećeno prilikom vezanja na homo- DNA i homo-RNA. Takav obrazac prepoznavanja pripisuje se strukturnim razlikama između polinukleotida, gdje samo alternirajuće DNA imaju tipičnu B-helikalnu strukturu. Dakle, oba klorirana analoga istraživanih boja pokazuju nova svojstva molekulskog prepoznavanja u odnosu na ishodne TOTO i YOYO, koje u kombinaciji sa zanemarivom citotoksičnošću otvaraju potencijal za razvoj novih boja za biokemijske i biomedicinske aplikacije.
Sažetak (engleski)
Introduction of chloro-substituent at cyanine chromophore of well-known DNA stains TOTO and YOYO resulted in a significant difference of DNA and RNA recognition with respect to parent compounds (TOTO; YOYO), as well as in respect to corresponding monomers (6-Cl-TO-1 and 6-Cl- YO-1). Studied novel compounds form non-covalent complexes with ds-DNA/RNA which exhibited high stability Ks > 107 dm3 mol−1, with minor differences in binding constants between various DNA and RNA. 6-Cl-YOYO-1 revealed specific fluorimetric recognition of ds-RNA in comparison to ds- DNA by the fluorimetric response at 570 nm, which was attributed to particular aggregation property of the dye, not present in corresponding 6-Cl-TOTO-1 analogue. The 6-Cl-TOTO-1, unlike YOanalogue, showed ICD band at 520 nm only upon binding to alternating DNA sequences (both, GCGC and AT-AT), which was not observed for homo-DNA and homo-RNA. Such recognition pattern was attributed to structural differences between polynucleotides, whereby only alternating-DNAs have a typical B-helical structure in which 6-Cl-TOTO-1 molecule could insert to give particular ICD band at 520 nm. Thus, both Cl-analogues showed intriguing novel recognition properties in comparison to parent TOTO and YOYO, which combined with negligible cytotoxicity offer potential for development of novel dyes for biochemical and biomedical applications.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:217:721510
Studijski programNaziv: Kemija
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: poslijediplomski doktorski
Akademski / stručni naziv: doktor/doktorica znanosti, područje prirodnih znanosti, polje kemija (dr. sc.)
Vrsta resursaTekst
Opseg143 str. ; 30 cm
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaOtvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2019-01-08 10:28:24