prikaz prve stranice dokumenta Varijabilnost gena rplF i tufB izolata fitoplazme flavescence dorée - uzročnika bolesti žutica vinove loze
  Preuzmi
PDF 1.61 MB
diplomski rad
Varijabilnost gena rplF i tufB izolata fitoplazme flavescence dorée - uzročnika bolesti žutica vinove loze
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2019. urn:nbn:hr:217:821500
Knezović, Ivan
Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Biološki odsjek

Institucijski repozitorij: Repozitorij Prirodoslovno-matematičkog fakulteta

Citirajte ovaj rad

Knezović, I. (2019). Varijabilnost gena rplF i tufB izolata fitoplazme flavescence dorée - uzročnika bolesti žutica vinove loze (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:821500

Knezović, Ivan. "Varijabilnost gena rplF i tufB izolata fitoplazme flavescence dorée - uzročnika bolesti žutica vinove loze." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2019. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:821500

Knezović, Ivan. "Varijabilnost gena rplF i tufB izolata fitoplazme flavescence dorée - uzročnika bolesti žutica vinove loze." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2019. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:821500

Knezović, I. (2019). 'Varijabilnost gena rplF i tufB izolata fitoplazme flavescence dorée - uzročnika bolesti žutica vinove loze', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 12.05.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:821500

Knezović I. Varijabilnost gena rplF i tufB izolata fitoplazme flavescence dorée - uzročnika bolesti žutica vinove loze [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2019 [pristupljeno 12.05.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:821500

I. Knezović, "Varijabilnost gena rplF i tufB izolata fitoplazme flavescence dorée - uzročnika bolesti žutica vinove loze", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2019. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:821500

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:821500
Podaci o radu
NaslovVarijabilnost gena rplF i tufB izolata fitoplazme flavescence dorée - uzročnika bolesti žutica vinove loze
Naslov (engleski)Variability of rplF and tufB genes in flavescence dorée phytoplasma isolates
AutorIvan Knezović
MentorMartina Šeruga Musić (mentor)
Član povjerenstvaMartina Šeruga Musić (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaSandra Radić Brkanac (član povjerenstva)
Član povjerenstvaDanijel Orešić (član povjerenstva)
Član povjerenstvaBlanka Cvetko Tešović (član povjerenstva)
Član povjerenstvaNeven Bočić (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Biološki odsjek)
Zagreb
Datum i država obrane2019-01-24, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Biologija
Sažetak
Fitoplazme (rod 'Candidatus Phytoplasma') su bakterije bez staniĉne stijenke izrazito reduciranih genoma koje parazitiraju u floemu biljaka i stanicama kukaca, a nije ih moguće uzgajati u ĉistoj kulturi in vitro. Uzrokuju velik broj ekonomski znaĉajnih bolesti biljaka u cijelom svijetu meĊu kojima su i ţutice vinove loze. Svrstane su u razred Mollicutes unutar kojeg tvore veliku monofiletsku grupu. Prenose se kukcima-vektorima iz reda Hemiptera koji se hrane floemom te zaraţenim sadnim materijalom. Postoje dvije fitoplazmatske vrste koje su većinski uzroĉnici ţutica vinove loze u Europi: flavescence dorée (FD) i bois noir (BN; Candidatus 'Phytoplasma solani'). Cilj ovog diplomskog rada bio je tipizacija izolata fitoplazme FD analizom konstitutivnih gena rplF (gen za 50S ribosomski protein L6) i tufB (gen za elongacijski faktor EF-Tu) koji do sada nisu korišteni kao molekularni markeri u multigenskoj tipizaciji ove fitoplazmatske vrste. U analizu su ukljuĉeni uzorci vinove loze i biljaka iz okoline vinograda, kao i kukaca-vektora, prethodno prikupljeni na lokacijama na podruĉju ĉitave kontinentalne Hrvatske i Istarske ţupanije. Fragmenti gena rplF i tufB umnoţeni su lanĉanom reakcijom polimerazom te sekvencirani. Sravnjivanjem i filogenetskom analizom dobivenih nukleotidnih sljedova gena rplF i tufB utvrĊeno je postojanje 5, odnosno 6 razliĉitih genotipova meĊu analiziranim uzorcima. Gen rplF se pokazao konzerviranijim od gena tufB, ali su se zbog svoje varijabilnosti oba pokazala kao potencijalno dobri kandidati za dodatne molekularne markere u tipizaciji fitoplazme FD.
Sažetak (engleski)
Phytoplasmas (genus 'Candidatus Phytoplasma') are non-cultivable wall-less bacteria from the class Mollicutes, with extremely reduced genomes, found in plant phloem and insect vector cells. They cause many economically important diseases worldwide including Grapevine yellows (GY) diseases. Diseases are transmitted by infected planting material and phloem-feeding insects – vectors of the order Hemiptera. Two phytoplasma species are major causeing agents of GY: flavescence dorée (FD) and bois noir (BN; Candidatus 'Phytoplasma solani'). The aim of this thesis was to perform typing of phytoplasma FD isolates by analysis of housekeeping genes rplF (encoding 50S ribosomal protein L6) and tufB (encoding the elongation factor EF-Tu). These genes have not been commonly used as molecular markers in multilocus sequence typing (MLST) of phytoplasma FD so far. The analysis included samples of grapevine, wild plants from the vicinity of vineyards and insect-vectors previously collected all over continental Croatia and in Istrian county. Fragments of rplF and tufB genes were amplified by PCR and sequenced. Alignment and phylogenetic analysis of rplF and tufB gene fragments revealed the presence of 5 and 6 genotypes, respectively. Gene rplF showed to be more conserved than the tufB gene, but both proved as good candidates as potential additional molecular markers for FD phytoplasma genotyping due to their variability.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:217:821500
Studijski programNaziv: Znanosti o okolišu
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/magistra struke znanosti o okolišu (mag. oecol.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaOtvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2019-03-28 10:52:21