prikaz prve stranice dokumenta Računalna analiza metagenoma probavnog sustava bolesnika s cirozom jetre
  Preuzmi
PDF 1.47 MB
diplomski rad
Računalna analiza metagenoma probavnog sustava bolesnika s cirozom jetre
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2015. urn:nbn:hr:217:822043
Fabijanić, Maja
Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Biološki odsjek

Institucijski repozitorij: Repozitorij Prirodoslovno-matematičkog fakulteta

Citirajte ovaj rad

Fabijanić, M. (2015). Računalna analiza metagenoma probavnog sustava bolesnika s cirozom jetre (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:822043

Fabijanić, Maja. "Računalna analiza metagenoma probavnog sustava bolesnika s cirozom jetre." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2015. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:822043

Fabijanić, Maja. "Računalna analiza metagenoma probavnog sustava bolesnika s cirozom jetre." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2015. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:822043

Fabijanić, M. (2015). 'Računalna analiza metagenoma probavnog sustava bolesnika s cirozom jetre', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 07.01.2025., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:822043

Fabijanić M. Računalna analiza metagenoma probavnog sustava bolesnika s cirozom jetre [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2015 [pristupljeno 07.01.2025.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:822043

M. Fabijanić, "Računalna analiza metagenoma probavnog sustava bolesnika s cirozom jetre", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2015. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:822043

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:822043
Podaci o radu
NaslovRačunalna analiza metagenoma probavnog sustava bolesnika s cirozom jetre
Naslov (engleski)Computational analysis of metagenomes of the intestinal tract in patients with liver cirrhosis
AutorMaja Fabijanić
MentorKristian Vlahoviček (mentor)
Član povjerenstvaKristian Vlahoviček (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaDamjan Franjević (član povjerenstva)
Član povjerenstvaMartina Šeruga Musić (član povjerenstva)
Član povjerenstvaDunja Leljak-Levanić (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Biološki odsjek)
Zagreb
Datum i država obrane2015-06-30, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Biologija
Sažetak
Prokarioti zauzimaju dvije od tri domene života, a samo se 1-5% bakterija može uzgojiti u laboratorijskim uvjetima. Metabolizam čovjeka ne bi bio potpun bez metabolizma mikroba koji ga nastanjuju, a oni imaju utjecaja i u raznim bolestima kao što su pretilost, upalna bolest crijeva, simptomatična ateroskleroza i bolesti jetre. Metagenomika je pristup koji nam omogućava proučavanje mikrobnih genoma uzorkovanjem izravno iz okoliša, nakom čega analizom obrazaca upotrebe sinonimnih kodona možemo odrediti gene optimirane za translaciju što je u korelaciji s ekspresijom tih gena. Na ovaj način odredila sam razinu translacijske optimizacije gena u crijevnim metagenomima bolesnika s cirozom jetre i usporedila ju sa onom zdravih pojedinaca. Gene sam prema razini translacijske optimizacije i ishodišnom uzorku klasificirala u skupine povezane sa zdravim i bolesnim fenotipom, a zatim i razvrstala u pripadne metaboličke putove. Nejednaka zastupljenost translacijski optimiranih gena u različitim metaboličkim putovima crijevnih mikrobnih zajednica zdravih i bolesnih pojedinaca otvara mogućnost za olakšanu djagnostiku ciroze jetre ali i mehanistički uvid u interakciju između mikrobnog i ljudskog metabolizma u razvoju bolesti.
Sažetak (engleski)
Prokaryotes occupy two of the three domains of life, and only 1-5% of bacteria can be grown in laboratory conditions. Human metabolism would not be complete without metabolism of microbes that inhabit it, and they have an impact in various diseases such as obesity, inflammatory bowel disease, symptomatic atherosclerosis and liver disease. Metagenomics is an approach that allows us to study the microbial genome by sampling directly from the environment, followed by analyzing patterns of use of synonymous codons. In this way I determined the level of translational optimization of genes in intestinal metagenomes of cirrhotic patients and compared it with that of healthy individuals. Based on levels of translational optimization and initial sample, I have classified genes into groups associated with healthy and diseased phenotype, and then sorted them in their corresponding metabolic pathways. Unequal representation of translationally optimized genes in different metabolic pathways of intestinal microbial communities of healthy and sick individuals opens up a possibility for easier diagnosis of liver cirrhosis as well as mechanistic insight into the interaction between microbial and human metabolism in development of this disease.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:217:822043
Studijski programNaziv: Molekularna biologija
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/magistra molekularne biologije (mag. biol. mol.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaOtvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2017-04-21 09:51:14