Sulfonamidi su grupa antibiotika koja se primjenjuje u veterinarskoj medicini te mnogo rjeđe u humanoj medicini. Sulfonamidi su amfoterni spojevi koji ovisno o pH-vrijednosti mogu biti pozitivno ili negativno nabijeni. Analiza sulfonamida u površinskim vodama obično uključuje četiri koraka: uzorkovanje, pripremu uzorka, kromatografsko odvajanje te detekciju. Prikupljanje uzoraka mora se odvijati u pravilnim vremenskim razmacima kako bi konačni rezultati bili pouzdani i reprezentativni. S obzirom na nisku koncentraciju sulfonamida u okolišu potrebno je primijeniti osjetljive analitičke tehnike za njihovo određivanje. Vrlo važan korak predstavlja priprema uzorka za analizu. Najčešće se koristi ekstrakcija na čvrstoj fazi pri čemu se uzorci ukoncentriravaju i pročišćavaju za daljnje kromatografsko odvajanje. Za odjeljivanje sulfonamida najčešće se koristi tekućinska kromatografija visoke djelotvornosti (HPLC), a za detekciju tandemna spektrometrija masa (MS/MS) koja omogućuje veliku selektivnost i bolju osjetljivost u odnosu na ostale metode detekcije (fluorescencija, apsorpcija). Kao analizatorom masa pri LC-MS/MS analizi obično se koristi trostruki kvadrupol (QqQ). Kako bi se spriječio problem povezivanja tekućinske kromatografije i spektrometrije masa, koriste se odgovarajuće ionizacijske tehnike. Za analizu antibiotika najčešće se koristi elektroraspršenje (ESI) zbog mogućnosti ionizacije kiselih, bazičnih, neutralnih i termolabilnih analita.