prikaz prve stranice dokumenta Određivanje količine proteina Cas3 u mutantima Δhns i ΔhtpG bakterije Escherichia coli u različitim uvjetima rasta
  Preuzmi
PDF 1.19 MB
diplomski rad
Određivanje količine proteina Cas3 u mutantima Δhns i ΔhtpG bakterije Escherichia coli u različitim uvjetima rasta
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2019. urn:nbn:hr:217:845868
Macuka, Marin
Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Biološki odsjek

Institucijski repozitorij: Repozitorij Prirodoslovno-matematičkog fakulteta

Citirajte ovaj rad

Macuka, M. (2019). Određivanje količine proteina Cas3 u mutantima Δhns i ΔhtpG bakterije Escherichia coli u različitim uvjetima rasta (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:845868

Macuka, Marin. "Određivanje količine proteina Cas3 u mutantima Δhns i ΔhtpG bakterije Escherichia coli u različitim uvjetima rasta." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2019. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:845868

Macuka, Marin. "Određivanje količine proteina Cas3 u mutantima Δhns i ΔhtpG bakterije Escherichia coli u različitim uvjetima rasta." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2019. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:845868

Macuka, M. (2019). 'Određivanje količine proteina Cas3 u mutantima Δhns i ΔhtpG bakterije Escherichia coli u različitim uvjetima rasta', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 31.12.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:845868

Macuka M. Određivanje količine proteina Cas3 u mutantima Δhns i ΔhtpG bakterije Escherichia coli u različitim uvjetima rasta [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2019 [pristupljeno 31.12.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:845868

M. Macuka, "Određivanje količine proteina Cas3 u mutantima Δhns i ΔhtpG bakterije Escherichia coli u različitim uvjetima rasta", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2019. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:845868

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:845868
Podaci o radu
NaslovOdređivanje količine proteina Cas3 u mutantima Δhns i ΔhtpG bakterije Escherichia coli u različitim uvjetima rasta
Naslov (engleski)Determining the quantity of the Cas3 protein in Δhns and ΔhtpG mutants in Escherichia coli under different growth conditions
AutorMarin Macuka
MentorIvana Ivančić Baće (mentor)
MentorPetra Peharec Štefanić (mentor)
MentorKristina Majsec (mentor)
Član povjerenstvaIvana Ivančić Baće (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaPetra Peharec Štefanić (član povjerenstva)
Član povjerenstvaŽeljka Vidaković Cifrek (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Biološki odsjek)
Zagreb
Datum i država obrane2019, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Biologija
Sažetak
Sustav CRISPR-Cas je obrambeni mehanizam mnogih prokariota od infekcija stranim nukleinskim kiselinama poput virusa i plazmida. Lokus CRISPR sastoji se od niza palindromskih ponavljajućih sekvenci razdvojenih razmaknicama, podrijetlom iz faga ili plazmida. Uz lokus CRISPR nalaze se pridruženi geni cas, čijom ekspresijom nastaju proteini Cas koji sudjeluju u obrambenom mehanizmu. Lokus se prepisuje u dugu prekursorsku RNA koja se procesira u manje RNA zvane CRISPR-RNA (crRNA) koje se spajaju s jednim ili više proteina Cas. Taj kompleks pronalazi strane DNA temeljem komplementarnosti sekvenci, te nakon uspješnog prepoznavanja, nastaje R-omča. Tu strukturu prepoznaje protein Cas3 koji nakon vezanja cijepa stranu DNA. Nekoliko čimbenika utječe na aktivnost sustava CRISPR-Cas u bakteriji E. coli: temperatura, protein H-NS, te šaperon HtpG. Pri 37 0C uočen je gubitak aktivnosti proteina Cas3 iz nepoznatih razloga. U ovom radu istraživana je količina proteina Cas3 u sojevima uzgojenim pri temperaturi od 30 0C i 37 0C, te u sojevima s mutiranim genima hns, htpG ili oba. Analizom količine proteina Cas3 u različitim mutantama bakterije E. coli, nije uočena razlika u količini proteina Cas3 u ovisnosti o temperaturi rasta, već u ovisnosti o genotipu mutanta i to mutaciji hns.
Sažetak (engleski)
The CRISPR-Cas system is a defense mechanism employed by many prokaryotes against foreign nucleic acids infections, e.g. viruses and plasmids. The locus CRISPR consists of a series of short palindromic repeats separated by spacers derived from foreign DNA. Near the CRISPR array are cas genes which encode Cas proteins that participate in the defense mechanism. The array is transcribed into a long precursor RNA that is processed into smaller RNA called CRISPR-RNA (crRNA) that fuse with one or more Cas proteins. This complex finds foreign DNA through complementary base pairing, which if successful, generates an R-loop. This structure is recognized by Cas3 which cleaves the foreign DNA after binding. Several factors affect the activity of CRISPR-Cas in E. coli - temperature, protein H-NS, and chaperon HtpG. A loss of Cas3 activity was observed at 37 0C due to unknown reasons. In this work, the amounts of Cas3 were determined in strains grown at 30 0C and 37 0C, and also in strains that contained mutation in hns, htpG gene or both. Differences in Cas3 amounts in different E. coli mutants weren't dependent on the growth temperature, but rather on the mutant's genotype, specifically hns mutation.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:217:845868
Studijski programNaziv: Profesor biologije
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: dodiplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/magistra edukacije biologije (mag. educ. biol.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaOtvoreni pristup
Datum isteka embarga: 2020-09-27
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2019-11-29 10:36:54