prikaz prve stranice dokumenta Filostratigrafska analiza bakterije Bacillus subtilis
Pristup korisnicima matične ustanove
diplomski rad
Filostratigrafska analiza bakterije Bacillus subtilis
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2014. urn:nbn:hr:217:209926
Lenuzzi, Maša
Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Biološki odsjek

Institucijski repozitorij: Repozitorij Prirodoslovno-matematičkog fakulteta

Citirajte ovaj rad

Lenuzzi, M. (2014). Filostratigrafska analiza bakterije Bacillus subtilis (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:209926

Lenuzzi, Maša. "Filostratigrafska analiza bakterije Bacillus subtilis." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2014. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:209926

Lenuzzi, Maša. "Filostratigrafska analiza bakterije Bacillus subtilis." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2014. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:209926

Lenuzzi, M. (2014). 'Filostratigrafska analiza bakterije Bacillus subtilis', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 04.11.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:209926

Lenuzzi M. Filostratigrafska analiza bakterije Bacillus subtilis [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2014 [pristupljeno 04.11.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:209926

M. Lenuzzi, "Filostratigrafska analiza bakterije Bacillus subtilis", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2014. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:209926

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:209926
Podaci o radu
NaslovFilostratigrafska analiza bakterije Bacillus subtilis
Naslov (engleski)Phylostratigraphic analyses of bacterium Bacillus subtilis
AutorMaša Lenuzzi
MentorTomislav Domazet-Lošo (mentor)
MentorDunja Leljak-Levanić (mentor)
Član povjerenstvaDunja Leljak-Levanić (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaTomislav Domazet-Lošo (član povjerenstva)
Član povjerenstvaDamjan Franjević (član povjerenstva)
Član povjerenstvaMladen Kučinić (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Biološki odsjek)
Zagreb
Datum i država obrane2014-02-28, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Biologija
Sažetak
Filogenija bakterija predmet je neslaganja unutar znanstvene zajednice sve od njihovog otkrića u 17. stoljeću i još do danas se ne nazire općeprihvaćeno riješenje. Brojni problemi, od kojih su najznačajniji horizontalni transfer i brza stopa mutacija bakterijskog genoma, otežavaju izradu robusnog filogenetskog stabla bakterija. Genomska filostratigrafija jedna je od metoda proučavanja evolucije vrste. Filostratigrafske analize dosad su rađene samo na eukariotima. U ovom radu izrađena je prva filostratigrafska mapa bakterije na soju Bacilus subtilis subsp. subtilis str. 168. Rezultati su pokazali jasnu preraspodjelu gena po filostratumima što ukazuje na značajni vertikalni prijenos gena tijekom evolucije bakterija. Postojanost filostratigrafske mape provjerena je analizom reduciranih proteinskih baza dobivenih klasteriranjem proteinskih sljedova izvorne baze eukariota, arheja i bakterija. Primjena filostrastigrafske analize na reduciranim bazama rezultirala je gotovo identičnom filostratigrafskom mapom što potvrđuje robusnost metode za analizu bakterijskih genoma.
Sažetak (engleski)
Bacterial phylogeny has been highly controversial subject from the first description of bacteria in 17th. century, and it seems that generally accepted solution is not yet within reach. There are many issues related to bacterial phylogeny, of which most important are horizontal gene transfer and fast mutation rate in bacterial genomes. For these reasons it is hard to construct a robust phylogenetic tree of bacteria. Genomic phylostratigraphy is a method for tracking evolutionary context of species. Until now, phylostratigraphic maps have been made solely in eukaryotes. In this thesis first phylostratigraphic map of a bacterium, namely Bacilus subtilis subsp. subtilis str. 168 strain, was obtained. Results showed clear distribution of genes through phylostrata, pointing to significance of vertical gene transfer in bacterial evolution. The robustness of the map was additionally tested on reduced protein databases obtained by clustering of original protein database of Eukarya, Archaea and Bacteria. Results obtained by using phylostratigraphic analyses on reduced protein databases resulted in nearly identical phylostratigraphic maps.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:217:209926
Studijski programNaziv: Molekularna biologija
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/magistra molekularne biologije (mag. biol. mol.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaPristup korisnicima matične ustanove
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2017-04-26 10:23:00