prikaz prve stranice dokumenta Kinetička karakterizacija homologno nadeksprimiranih izoleucil-tRNA-sintetaza iz bakterije Bacillus megaterium
  Preuzmi
PDF 3.37 MB
diplomski rad
Kinetička karakterizacija homologno nadeksprimiranih izoleucil-tRNA-sintetaza iz bakterije Bacillus megaterium
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2020. urn:nbn:hr:217:456924
Božić, Bartol
Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Kemijski odsjek

Institucijski repozitorij: Repozitorij Prirodoslovno-matematičkog fakulteta

Citirajte ovaj rad

Božić, B. (2020). Kinetička karakterizacija homologno nadeksprimiranih izoleucil-tRNA-sintetaza iz bakterije Bacillus megaterium (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:456924

Božić, Bartol. "Kinetička karakterizacija homologno nadeksprimiranih izoleucil-tRNA-sintetaza iz bakterije Bacillus megaterium." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2020. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:456924

Božić, Bartol. "Kinetička karakterizacija homologno nadeksprimiranih izoleucil-tRNA-sintetaza iz bakterije Bacillus megaterium." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2020. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:456924

Božić, B. (2020). 'Kinetička karakterizacija homologno nadeksprimiranih izoleucil-tRNA-sintetaza iz bakterije Bacillus megaterium', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 22.11.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:456924

Božić B. Kinetička karakterizacija homologno nadeksprimiranih izoleucil-tRNA-sintetaza iz bakterije Bacillus megaterium [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2020 [pristupljeno 22.11.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:456924

B. Božić, "Kinetička karakterizacija homologno nadeksprimiranih izoleucil-tRNA-sintetaza iz bakterije Bacillus megaterium", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2020. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:456924

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:456924
Podaci o radu
NaslovKinetička karakterizacija homologno nadeksprimiranih izoleucil-tRNA-sintetaza iz bakterije Bacillus megaterium
Naslov (engleski)Kinetic characterization of homologously overexpressed isoleucyl-tRNA synthetates in Bacillus megaterium
AutorBartol Božić
MentorIta Gruić Sovulj (mentor)
Član povjerenstvaIta Gruić Sovulj (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaDavor Kovačević (član povjerenstva)
Član povjerenstvaIva Juranović Cindrić (član povjerenstva)
Član povjerenstvaMarko Močibob (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Kemijski odsjek)
Zagreb
Datum i država obrane2020-09-01, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Kemija
Sažetak
Izoleucil–tRNA–sintetaze (IleRS) su enzimi koji u dva koraka kataliziraju nastajanje kovalentne veze između izoleucina (Ile) i pripadne molekule tRNAIle u procesu biosinteze proteina. U prvom koraku, koji se naziva aktivacija, nastaje izoleucil–adenilat dok se u drugom koraku aktivirana aminokiselina prenosi na molekulu tRNAIle. Postoje dva tipa IleRS koji se razlikuju po strukturnim karakteristikama i rezistenciji na antibiotik mupirocin. Genom bakterije Bacillus megaterium neuobičajeno sadrži gene za oba tipa IleRS, što čini navedene proteine zanimljivim za istraživanje. U sklopu ovog rada, proteini IleRS1 i IleRS2 dobiveni su homolognom nadekspresijom u bakteriji B. megaterium te pročišćeni afinitetnom kromatografijom. Molekula tRNAIle heterologno je nadeksprimirana u bakteriji Escherichia coli i pročišćena kromatografijom obrnutih faza. Kinetička karakterizacija navedenih enzima je pokazala da u aktivaciji IleRS2 ima oko 25 × veći KM (Ile) od IleRS1. Međutim, u ukupnoj reakciji aminoacilacije, koja uključuje i molekulu tRNA, dolazi do znatne promjene KM (Ile) za oba enzima što rezultira većim KM (Ile) za IleRS1 u odnosu na IleRS2. To sugerira da interakcija s tRNA različito utječe na mehanistička svojstva IleRS1 i IleRS2.
Sažetak (engleski)
Isoleucyl–tRNA synthetases (IleRS) are enzymes that catalyze covalent attachment of amino acid isoleucine to the cognate tRNAIle during protein biosynthesis. The first step of the reaction (activation) results in the formation of isoleucyl adenylate, while the second step comprises the transfer of activated isoleucine to the cognate tRNAIle. There are two types of IleRSs that differ mainly in structural elements and resistance to antibiotic mupirocin. The genome of Bacillus megaterium uncommonly contains genes encoding both IleRSs making these proteins interesting for studying. Within this work, proteins IleRS1 and IleRS2 were homologously overexpressed in B. megaterium and purified by affinity chromatography. The tRNAIle molecule was overexpressed in Escherichia coli and purified by reverse–phase chromatography. The kinetic characterization of both enzymes showed that, in the activation step, IleRS2 has 25 × higher KM (Ile) than IleRS1. In overall aminoacylation, which includes the tRNA, the KM (Ile) values change for both enzymes, resulting in the higher KM (Ile) for IleRS1 than for IleRS2. The obtained results suggest that interaction with the tRNA promotes a different influence on the mechanistic properties of IleRS1 and IleRS2.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:217:456924
Studijski programNaziv: Kemija; smjerovi: istraživački
Smjer: istraživački
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/magistra kemije (mag. chem.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaOtvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2020-09-07 09:49:50