prikaz prve stranice dokumenta Ekspresija i primarna struktura gena ompK35 i ompK36 u kliničkih izolata Klebsiella pneumoniae (ST437) neosjetljivih na ertapenem
  Preuzmi
PDF 1.58 MB
diplomski rad
Ekspresija i primarna struktura gena ompK35 i ompK36 u kliničkih izolata Klebsiella pneumoniae (ST437) neosjetljivih na ertapenem
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2020. urn:nbn:hr:217:304802
Pejković, Mia
Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Biološki odsjek

Institucijski repozitorij: Repozitorij Prirodoslovno-matematičkog fakulteta

Citirajte ovaj rad

Pejković, M. (2020). Ekspresija i primarna struktura gena ompK35 i ompK36 u kliničkih izolata Klebsiella pneumoniae (ST437) neosjetljivih na ertapenem (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:304802

Pejković, Mia. "Ekspresija i primarna struktura gena ompK35 i ompK36 u kliničkih izolata Klebsiella pneumoniae (ST437) neosjetljivih na ertapenem." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2020. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:304802

Pejković, Mia. "Ekspresija i primarna struktura gena ompK35 i ompK36 u kliničkih izolata Klebsiella pneumoniae (ST437) neosjetljivih na ertapenem." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2020. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:304802

Pejković, M. (2020). 'Ekspresija i primarna struktura gena ompK35 i ompK36 u kliničkih izolata Klebsiella pneumoniae (ST437) neosjetljivih na ertapenem', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 18.12.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:304802

Pejković M. Ekspresija i primarna struktura gena ompK35 i ompK36 u kliničkih izolata Klebsiella pneumoniae (ST437) neosjetljivih na ertapenem [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2020 [pristupljeno 18.12.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:304802

M. Pejković, "Ekspresija i primarna struktura gena ompK35 i ompK36 u kliničkih izolata Klebsiella pneumoniae (ST437) neosjetljivih na ertapenem", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2020. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:304802

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:304802
Podaci o radu
NaslovEkspresija i primarna struktura gena ompK35 i ompK36 u kliničkih izolata Klebsiella pneumoniae (ST437) neosjetljivih na ertapenem
Naslov (engleski)Expression and primary structure of ompK35 and ompK36 genes of Klebsiella pneumoniae (ST437) clinical isolates non-susceptible to ertapenem
AutorMia Pejković
MentorArjana Tambić-Andrašević (mentor)
MentorJasna Hrenović (sumentor)
Član povjerenstvaJasna Hrenović (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaRenata Šoštarić (član povjerenstva)
Član povjerenstvaPetra Peharec Štefanić (član povjerenstva)
Član povjerenstvaTomislav Ivanković (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Biološki odsjek)
Zagreb
Datum i država obrane2020-02-28, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Biologija
Sažetak
Karbapenemi su antibiotici zadnje linije obrane u liječenju infekcija izazvanih višestruko otpornim enterobakterijama otpornim na cefalosporine proširenog spektra, među kojima značajnu ulogu ima Klebsiella pneumoniae. Otpornost na karbapeneme postao je globalni zdravstveni problem. Proizvodnja karbapenemaza je najefikasniji mehanizam otpornosti na karbapeneme, no mehanizmi otpornosti na ovu klasu antibiotika, poglavito ertapenem, uključuju i hidrolizu ESBL enzimima u uvjetima smanjene koncentracije antibiotika u bakterijskoj stanici, proizašlih iz promjena u porinskim kanalima. OmpK35 i OmpK36 su hidrofilni porinski kanali K. pneumoniae koji omogućavaju unos nutrijenata i antibiotika u bakteriju. U ovom radu analizirane su promjene unutar gena ompK35 i ompK36 u kliničkih izolata K. pneumoniae ST437 smanjene osjetljivosti na ertapenem prikupljenih tijekom 2011./2012. godine u zagrebačkim bolnicama. Mehanizmi otpornosti su utvrđeni korištenjem metode lančane reakcije polimerazom, elektroforezom u agaroznom gelu i sekvenciranjem. Otpornost na ertapenem se utvrdila mjerenjem minimalnih inhibitornih koncentracija (MIC, mg/L) metodom mikrodilucije u kation-prilagođenom Muller-Hinton bujonu. Svi izolati su pokazali visoku stopu otpornosti na ertapenem i imali su značajno sniženu ekspresiju OmpK35 porinskog kanala (p<0.001). 47.8% izolata je imalo inserciju GD unutar L3 omče koja je povezana s pojačanom otpornosti na ertapenem. Svi izolati su imali promjene unutar gena ompK36 (insercije, delecije, supstitucije).
Sažetak (engleski)
Carbapenems are last line antibiotics that are used as a treatment of infections caused by Enterobacteriaceae non-susceptibile to extended spectrum cephalosporins, with Klebsiella pneumoniae as one of the most significant members of this family. Carbapenem resistance is major global health problem. Production of carbapenemases is the most efficient mechanism of carbapenem resistance, although mechanisams involved in carbapenem resistance involve ESBL enzymes that are able to hydrolyze this class of antibiotics in the presence of decreased concentration of antibiotics as a consequence of alternations of porins. Klebsiella pneumoniae hydrophilic porins OmpK35 and OmpK36 play role in intake of nutrients and antibiotics in bacterial cell. In this thesis structural alternations were analysed in ompK35 and ompK36 genes in clinical isolates of K. pneumoniae ST437. Isolates were collected during 2011/2012 in hospitals in Zagreb. Resistance mechanisms were determined by using polymerase chain reaction, agarose gel-electrophoresis and sequencing. Minimal inhibitory concentrations (MIC, mg/L) were measured by microdilution method in cation-adjusted Mueller-Hinton broth. All isolates showed high level of ertapenem resistance and significatly lower level of expression of gene ompK35 (p<0.001). 47.8% isolates had GD insertions in loop L3, previously shown to affect high level ertapenem resistance. Clinical isolates had alterations in ompK36 gene (insertions, deletions, substitutions).
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:217:304802
Studijski programNaziv: Molekularna biologija
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/magistra molekularne biologije (mag. biol. mol.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaOtvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2021-02-23 08:11:36