prikaz prve stranice dokumenta Analiza proteinskih nizova iz CoViD-a 19
  Preuzmi
PDF 542.55 KB
diplomski rad
Analiza proteinskih nizova iz CoViD-a 19
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2021. urn:nbn:hr:217:340025
Tušek, Helena
Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Matematički odsjek

Institucijski repozitorij: Repozitorij Prirodoslovno-matematičkog fakulteta

Citirajte ovaj rad

Tušek, H. (2021). Analiza proteinskih nizova iz CoViD-a 19 (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:340025

Tušek, Helena. "Analiza proteinskih nizova iz CoViD-a 19." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2021. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:340025

Tušek, Helena. "Analiza proteinskih nizova iz CoViD-a 19." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2021. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:340025

Tušek, H. (2021). 'Analiza proteinskih nizova iz CoViD-a 19', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 24.03.2025., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:340025

Tušek H. Analiza proteinskih nizova iz CoViD-a 19 [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2021 [pristupljeno 24.03.2025.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:340025

H. Tušek, "Analiza proteinskih nizova iz CoViD-a 19", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2021. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:340025

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:340025
Podaci o radu
NaslovAnaliza proteinskih nizova iz CoViD-a 19
Naslov (engleski)Analysis of protein sequences from CoViD 19
AutorHelena Tušek
MentorPavle Goldstein (mentor)
Član povjerenstvaPavle Goldstein (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaZoran Vondraček (član povjerenstva)
Član povjerenstvaDijana Ilišević (član povjerenstva)
Član povjerenstvaLjiljana Arambašić (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Matematički odsjek)
Zagreb
Datum i država obrane2021-03-04, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Matematika
Sažetak
Tema ovog diplomskog rada je analiza proteinskih nizova iz koronavirusa, tj. analiza proteina: E, M, N i S. U radu se statističkim analizama i primjenom tehnika strojnog učenja na višestruko poravnatim nizovima navedenih proteina pokušava pronaći dominantne mutacije. Na početku su dani matematički pojmovi potrebni za razumijevanje ostatka rada. Nakon toga, uvodi se struktura podataka na kojima su rađene analize te se podaci pripremaju za primjenu tehnika klasteriranja. Na kraju se... Više primjenjuje jedna od tehnika klasteriranja (k-means++ algoritam) i analiziraju se rezultati. Pri tome, analizira se svaki protein koronavirusa zasebno i traže se najznačajnije pozicije za upravo takvo klasteriranje koje je dobiveno. Diplomski rad je većinom napravljen u programskom jeziku Python. Uz njega korišten je programski jezik R te za vizualizaciju rezultata Tableau. Sakrij dio sažetka
Sažetak (engleski)
The topic of this thesis is the analysis of the Coronavirus protein sequences, i.e. study of proteins E, M, N, and S. By applying statistical analysis and machine learning techniques to multiple sequence alignment of a given protein – we aim to determine dominant mutations. The introduction contains a description of the mathematical framework. After that, a data structure used for the analysis is introduced, and data is prepared for the application of the clustering method. In... Više the final part of the paper, one of the clustering methods (k-means++ algorithm) is applied, and the results are analyzed. In doing so, each Coronavirus protein is analyzed separately, and the goal is to find the most significant positions responsible for the obtained clustering. The thesis has been pre-developed using programming languages Python and R, while Tableau was used for the visualization of the data. Sakrij dio sažetka
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:217:340025
Studijski programNaziv: Matematička statistika
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/magistra matematike (mag. math.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaOtvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2021-03-26 10:22:08
accessibility

closePristupačnostrefresh

Ako želite spremiti trajne postavke, kliknite Spremi, ako ne - vaše će se postavke poništiti kad zatvorite preglednik.