prikaz prve stranice dokumenta Karakterizacija interakcije proteina BLNK i receptorne tirozin-kinaze MET uporabom ligacije proteina posredovane pocijepanim inteinom
  Preuzmi
PDF 4.46 MB
diplomski rad
Karakterizacija interakcije proteina BLNK i receptorne tirozin-kinaze MET uporabom ligacije proteina posredovane pocijepanim inteinom
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2021. urn:nbn:hr:217:560473
Valla, Robert
Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Biološki odsjek

Institucijski repozitorij: Repozitorij Prirodoslovno-matematičkog fakulteta

Citirajte ovaj rad

Valla, R. (2021). Karakterizacija interakcije proteina BLNK i receptorne tirozin-kinaze MET uporabom ligacije proteina posredovane pocijepanim inteinom (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:560473

Valla, Robert. "Karakterizacija interakcije proteina BLNK i receptorne tirozin-kinaze MET uporabom ligacije proteina posredovane pocijepanim inteinom." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2021. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:560473

Valla, Robert. "Karakterizacija interakcije proteina BLNK i receptorne tirozin-kinaze MET uporabom ligacije proteina posredovane pocijepanim inteinom." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2021. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:560473

Valla, R. (2021). 'Karakterizacija interakcije proteina BLNK i receptorne tirozin-kinaze MET uporabom ligacije proteina posredovane pocijepanim inteinom', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 27.12.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:560473

Valla R. Karakterizacija interakcije proteina BLNK i receptorne tirozin-kinaze MET uporabom ligacije proteina posredovane pocijepanim inteinom [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2021 [pristupljeno 27.12.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:560473

R. Valla, "Karakterizacija interakcije proteina BLNK i receptorne tirozin-kinaze MET uporabom ligacije proteina posredovane pocijepanim inteinom", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2021. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:560473

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:560473
Podaci o radu
NaslovKarakterizacija interakcije proteina BLNK i receptorne tirozin-kinaze MET uporabom ligacije proteina posredovane pocijepanim inteinom
Naslov (engleski)Characterization of BLNK protein interaction with receptor tyrosine-kinase MET using split intein-mediated protein ligation
AutorRobert Valla
MentorIgor Štagljar (mentor)
MentorNataša Bauer (sumentor)
Član povjerenstvaNataša Bauer (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaNada Oršolić (član povjerenstva)
Član povjerenstvaMarin Ježić (član povjerenstva)
Član povjerenstvaPetra Korać (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Biološki odsjek)
Zagreb
Datum i država obrane2021-07-19, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Biologija
Sažetak
Receptorna tirozin-kinaza MET je protoonkogen uključen u razne fiziološke procese, sudjeluje u tkivnoj homeostazi i regeneraciji te u brojnim patofiziološkim stanjima, primjerice različitim tipovima raka. Protein BLNK je središnji adaptorni protein nizvodno od signalne kaskade B-staničnog receptora. Protein BLNK omogućuje stvaranje multimolekularnih signalnih kompleksa, što prethodi sazrijevanju limfocita B. Protein BLNK je novo opisani interackijski partner receptora MET te bi interakcija receptora MET i proteina BLNK mogla imati jedinstvenu biološku značajnost. U ovom istraživanju je u svrhu karakterizacije interakcije receptora MET i proteina BLNK korištena nova metoda istraživanja proteinskih interakcija zvana ligacija proteina posredovana pocijepanim inteinom (engl. SIMPL). Interakcija receptora MET i proteina BLNK je potvrđena te je istražena ovisnost interakcije o fosforilaciji. Uspostavljena je i okarakterizirana stanična linija sa stabilnom ekpresijom receptora MET i taj se stabilni sustav MET-SIMPL može upotrijebiti kao platforma za probir lijekova. Identificirane su aminokiseline odgovorne za interakciju receptora MET i proteina BLNK. Metoda SIMPL ELISA također je upotrebljena za određivanje veznih mjesta proteina GRB2 na protein BLNK te za istraživanje uloge proteina GRB2 u interakciji receptora MET i proteina BLNK. Dobiveni rezultati pružaju bolji uvid u funkcionalne i mehanističke značajke interakcije receptora MET i proteina BLNK i proširuju razumijevanje biologije receptorne tirozin-kinaze MET.
Sažetak (engleski)
MET receptor tyrosine-kinase is a proto-oncogene involved in various physiological processes, such as tissue homeostasis and regeneration, as well as numerous pathophysiological conditions, such as different types of cancers. BLNK is a central adaptor protein downstream of the B-cell receptor signaling cascade, which enables the formation of multimolecular signaling complexes preceding the maturation of B lymphocytes. BLNK protein is a newly discovered interaction partner of MET, and MET-BLNK interaction may have a unique biological significance. A novel method to study protein-protein interactions called split intein-mediated protein ligation (SIMPL) was used in this research to characterize MET-BLNK interaction. MET-BLNK interaction was orthogonally confirmed and its phosphorylation-dependent nature was investigated using the SIMPL assay. The stable MET-SIMPL system was generated, characterized, and utilized as a drug screening platform. The amino acid residues on MET and BLNK responsible for MET-BLNK interaction were identified using SIMPL assay. SIMPL ELISA was used to determine the binding sites for GRB2 protein on BLNK and assess the role of GRB2 in MET-BLNK interaction. These results provided insight into functional and mechanistic features of MET-BLNK interaction and have deepened the understanding of MET receptor tyrosine-kinase biology.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:217:560473
Studijski programNaziv: Molekularna biologija
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/magistra molekularne biologije (mag. biol. mol.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaOtvoreni pristup
Datum isteka embarga: 2023-07-19
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2021-07-22 12:48:06