prikaz prve stranice dokumenta Molecular Modeling of PQQ-GDH for Application in Enzymatic Biofuel Cells
Pristup korisnicima matične ustanove
diplomski rad
Molecular Modeling of PQQ-GDH for Application in Enzymatic Biofuel Cells
Split: Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2023. urn:nbn:hr:166:918087
Matešić, Tome
Sveučilište u Splitu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Odjel za fiziku

Institucijski repozitorij: repozitorij.pmfst.unist.hr

Citirajte ovaj rad

Matešić, T. (2023). Molecular Modeling of PQQ-GDH for Application in Enzymatic Biofuel Cells (Diplomski rad). Split: Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:918087

Matešić, Tome. "Molecular Modeling of PQQ-GDH for Application in Enzymatic Biofuel Cells." Diplomski rad, Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2023. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:918087

Matešić, Tome. "Molecular Modeling of PQQ-GDH for Application in Enzymatic Biofuel Cells." Diplomski rad, Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2023. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:918087

Matešić, T. (2023). 'Molecular Modeling of PQQ-GDH for Application in Enzymatic Biofuel Cells', Diplomski rad, Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 20.12.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:918087

Matešić T. Molecular Modeling of PQQ-GDH for Application in Enzymatic Biofuel Cells [Diplomski rad]. Split: Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2023 [pristupljeno 20.12.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:918087

T. Matešić, "Molecular Modeling of PQQ-GDH for Application in Enzymatic Biofuel Cells", Diplomski rad, Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Split, 2023. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:918087

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:918087
Podaci o radu
NaslovMolecular Modeling of PQQ-GDH for Application in Enzymatic Biofuel Cells
Naslov (hrvatski)Molekularno modeliranje PQQ-GDH za primjene u enzimatskim biogorivnim ćelijama
AutorTome Matešić
MentorŽeljka Sanader Maršić (mentor)
Član povjerenstvaŽeljka Sanader Maršić (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaLarisa Zoranić (član povjerenstva)
Član povjerenstvaMarin Vojković (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Splitu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Odjel za fiziku)
Split
Datum i država obrane2023-09-29, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Fizika
Sažetak
In this thesis we use molecular modeling methods to analyze pyrroloquinoline-quinone glucose dehydrogenase (PQQ-GDH) enzyme with respect to its potential use as an enzymatic biofuel cell when complexed with single-walled carbon nanotubes (SWCNTs). Computer experiments in the form of molecular dynamics simulations are used as the principal investigative method. We run simulations using GROMACS package to determine the viability of usage of PQQ-GDH-SWCNT complex as a biofuel cell platform. Our analysis and subsequent discussion of results generated by in silico experiments point to the fact that this complex retains its stability and biological activity after solvation. This conclusion is in agreement with previously done experimental inquiries and it garners further research using computer simulations. Lastly, we propose and outline several concrete avenues of approach to gain more reliable insight about the feasibility of using PQQ-GDH-SWCNT as a biofuel cell using subsequent molecular dynamics simulations.
Sažetak (hrvatski)
U ovom radu koristimo metode moleuklarnog modeliranja kako bi analizirali enzim pirokinolin-kinon-ovisnu glukozu dehidrogenazu (PQQ-GDH) u kontekstu njegove potencijalne primjene u obliku enzimatske biogorivne ćelije kada je uparen s jednozidnim ugljikovim nanocijevima (SWCNT). Računalni eksperimenti u obliku simulacija molekularne dinamike su bili glavna istraživačka metoda. GROMACS je korišten kako bi odredili da li je PQQ-GDH-SWCNT kompleks potencijalna platforma za enzimatsku biogorivnu ćeliju. Naša analiza i diskusija rezultata generiranih in silico eksperimentima ukazuju na činjenicu da ovaj kompleks zadržava svoju stabilnost i biološku aktivnost nakon solvacije. Ovaj zaključak je u skladu s prethodnim eksperimentalnim istraživanjima i motivira daljnje ispitivanje korištenjem računalnih simulacija. Naposljetku, predlažemo i opisujemo nekoliko istraživačkih pristupa kako bi dobili kvalitetniji uvid o isplativosti korištenja PQQ-GDH-SWCNT kao biogorivne ćelije pomoću simulacija molekularnom dinamikom.
Ključne riječi
Ključne riječi (hrvatski)
Jezikengleski
URN:NBNurn:nbn:hr:166:918087
Studijski programNaziv: Fizika; smjerovi: Nastavnički, Astrofizika, Biofizika, Fizika okoliša, Računarska fizika, Astrofizika i fizika elementarnih čestica
Smjer: Biofizika
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/magistra fizike (mag. phys.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaPristup korisnicima matične ustanove
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2023-10-19 13:18:48