prikaz prve stranice dokumenta Studija povezanosti fizikalnih i kemijskih svojstava signalnih peptida s antimikrobnom funkcijom pridruženih zrelih peptida
Rad nije dostupan
diplomski rad
Studija povezanosti fizikalnih i kemijskih svojstava signalnih peptida s antimikrobnom funkcijom pridruženih zrelih peptida
Split: Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2019. urn:nbn:hr:166:945123
Kablar, Petar
Sveučilište u Splitu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Odjel za fiziku

Institucijski repozitorij: repozitorij.pmfst.unist.hr

Citirajte ovaj rad

Kablar, P. (2019). Studija povezanosti fizikalnih i kemijskih svojstava signalnih peptida s antimikrobnom funkcijom pridruženih zrelih peptida (Diplomski rad). Split: Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:945123

Kablar, Petar. "Studija povezanosti fizikalnih i kemijskih svojstava signalnih peptida s antimikrobnom funkcijom pridruženih zrelih peptida." Diplomski rad, Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2019. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:945123

Kablar, Petar. "Studija povezanosti fizikalnih i kemijskih svojstava signalnih peptida s antimikrobnom funkcijom pridruženih zrelih peptida." Diplomski rad, Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2019. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:945123

Kablar, P. (2019). 'Studija povezanosti fizikalnih i kemijskih svojstava signalnih peptida s antimikrobnom funkcijom pridruženih zrelih peptida', Diplomski rad, Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 11.10.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:945123

Kablar P. Studija povezanosti fizikalnih i kemijskih svojstava signalnih peptida s antimikrobnom funkcijom pridruženih zrelih peptida [Diplomski rad]. Split: Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2019 [pristupljeno 11.10.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:945123

P. Kablar, "Studija povezanosti fizikalnih i kemijskih svojstava signalnih peptida s antimikrobnom funkcijom pridruženih zrelih peptida", Diplomski rad, Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Split, 2019. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:945123

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:945123
Podaci o radu
NaslovStudija povezanosti fizikalnih i kemijskih svojstava signalnih peptida s antimikrobnom funkcijom pridruženih zrelih peptida
Naslov (engleski)The structure-function study relating physical and chemical properties of signal peptides to the antimicrobial function of associated mature peptides
AutorPetar Kablar
MentorDavor Juretić (mentor)
Član povjerenstvaDavor Juretić (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaLarisa Zoranić (član povjerenstva)
Član povjerenstvaŽeljka Sanader Maršić (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Splitu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Odjel za fiziku)
Split
Datum i država obrane2019-09-27, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Fizika
Sažetak
Signalne sekvence prepoznate su kao visoko očuvani dijelovi prekursora antimikrobnih peptida (AMP). Ovdje smo istražili sadrži li signalna sekvenca informaciju o antimikrobnoj funkciji AMP bogatih cisteinima. U usporedbi s peptidima bogatim cisteinima koji nemaju antimikrobnu aktivnost, defenzini i njima slični peptidi te ostali AMP bogati cisteinima su pretežno povezani sa signalnim sekvencama koje imaju veću srednju hidrofobnost njihovog najhidrofobnijeg dijela. Također pokazuju i jednostavniju raspodjelu aminokiselina u hidrofobnoj regiji, tako da su leucin, izoleucin, valin i fenilalanin zajedno zastupljeni od 70 do 90% na svakoj poziciji te regije. Kada se ta promatranja pretvore u jednostavan prediktor antimikrobne funkcije, njegova točnost je visoka za ljudski proteom iako struktura i homologija poznatih zrelih AMP nije korištena u njegovoj konstrukciji. Povezanost strukture signalne sekvence i funkcije zrelog peptida potvrdili smo također na proteomima drugih sisavaca te školjkaša.
Sažetak (engleski)
Signal sequences have been recognized as highly conserved parts of precursors for antimicrobial peptides (AMPs). We explored here if signal sequences contain information about antimicrobial function of Cys-rich AMPs. In comparison with Cys-rich peptides lacking antimicrobial activity, defensins, defensin-like peptides and other Cys-rich AMPs are predominantly associated with signal sequences having higher mean hydrophobicity of their most hydrophobic part. They also have simpler distribution of amino acids in hydrophobic region, such that Leucine, Isoleucine, Valine and Phenylalanine together fill 70 to 90% of each sequence position in that region. When this observation is converted into simple predictor for antimicrobial function its accuracy is high for human proteome, although it does not use structure and homology of known mature AMPs. We have confirmed the connection between signal sequence structure and function of mature peptide for other mammalian proteomes and for bivalves too.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:166:945123
Studijski programNaziv: Fizika; smjerovi: Nastavnički, Astrofizika, Biofizika, Fizika okoliša, Računarska fizika
Smjer: Računarska fizika
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/magistra fizike (mag. phys.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaZatvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2019-11-06 09:40:36