prikaz prve stranice dokumenta Ciljana inaktivacija gena GFP u E. coli metodom CRISPR/Cas9
Pristup svim korisnicima iz sustava znanosti i visokog obrazovanja RH
diplomski rad
Ciljana inaktivacija gena GFP u E. coli metodom CRISPR/Cas9
Split: Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2019. urn:nbn:hr:166:822193
Vuković, Mila
Sveučilište u Splitu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Odjel za fiziku

Institucijski repozitorij: repozitorij.pmfst.unist.hr

Citirajte ovaj rad

Vuković, M. (2019). Ciljana inaktivacija gena GFP u E. coli metodom CRISPR/Cas9 (Diplomski rad). Split: Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:822193

Vuković, Mila. "Ciljana inaktivacija gena GFP u E. coli metodom CRISPR/Cas9." Diplomski rad, Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2019. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:822193

Vuković, Mila. "Ciljana inaktivacija gena GFP u E. coli metodom CRISPR/Cas9." Diplomski rad, Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2019. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:822193

Vuković, M. (2019). 'Ciljana inaktivacija gena GFP u E. coli metodom CRISPR/Cas9', Diplomski rad, Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 02.06.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:822193

Vuković M. Ciljana inaktivacija gena GFP u E. coli metodom CRISPR/Cas9 [Diplomski rad]. Split: Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2019 [pristupljeno 02.06.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:822193

M. Vuković, "Ciljana inaktivacija gena GFP u E. coli metodom CRISPR/Cas9", Diplomski rad, Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Split, 2019. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:822193

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:822193
Podaci o radu
NaslovCiljana inaktivacija gena GFP u E. coli metodom CRISPR/Cas9
Naslov (engleski)Targeted inactivation of the GFP gene in E. coli by the CRISPR/Cas9 method
AutorMila Vuković
MentorJasna Puizina (mentor)
MentorIvica Aviani (komentor)
Član povjerenstvaJasna Puizina (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaIvica Aviani (član povjerenstva)
Član povjerenstvaIvica Šamanić (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Splitu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Odjel za fiziku)
Split
Datum i država obrane2019-10-22, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Fizika
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Biologija
Sažetak
U radu je prikazana primjena metode CRISPR/Cas9 za ciljanu inaktivaciju gena koji kodira za zeleni fluorescentni protein (GFP) u bakteriji E. coli. Eksperiment je proveden tako da su se primjenom bioinformatičkih alata dizajnirale vodeće RNA molekule čiji su odgovarajući DNA oligonukleotidi uneseni u plazmid BPK764. Ovaj plazmid je specifičan po tome što sadrži gen za kaspazu Cas9 i insercijsko mjesto za unos molekule sgRNA. Drugi ključni plazmid je pGLO jer on sadrži gen GFP čija je inaktivacija cilj ovog rada. Ova inaktivacije gena uspješno je provedena primjenom sustava CRISPR/Cas9 što je pokazano vizualizacijom kontrolnih i eksperimentalnih skupina bakterija na UV transiluminatoru. Bakterije obiju skupina snimljene su mikroskopom atomskih sila (AFM) primjenom kvantitativnog načina rada (QI) i invertnim optičkim mikroskopom s fluorescentnim filterom na kojem je također potvrđena uspješnost provedenog eksperimenta.
Sažetak (engleski)
This thesis presents the application of the CRISPR/Cas9 method for targeted inactivation of the gene encoding green fluorescent protein (GFP) in E. coli. The experiment was performed by designing single guide RNA molecules (sgRNA) using bioinformatics tools, whose corresponding DNA oligonucleotides were inserted into the BPK764 plasmid. This plasmid is specific because it contains the caspase 9 gene (cas9) and an insertion site for DNA oligonucleotide that correspond to sgRNA molecule. Another important plasmid is pGLO because it contains GFP gene whose inactivation is the goal of this thesis. This gene inactivation was successfully performed using the CRISPR/Cas9 system as evidenced by the visualization of control and experimental groups of bacteria on the UV transilluminator. The bacteria of both groups were imaged by an atomic force microscope (AFM) using a quantitative imaging mode (QI) and observed by an inverted optical microscope with the fluorescence option, which also showed the success of the experiment.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:166:822193
Studijski programNaziv: Fizika; smjerovi: Nastavnički, Astrofizika, Biofizika, Fizika okoliša, Računarska fizika
Smjer: Biofizika
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/magistra fizike (mag. phys.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaPristup svim korisnicima iz sustava znanosti i visokog obrazovanja RH
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2019-11-06 11:26:12