prikaz prve stranice dokumenta Ekspresija gena staničnog odgovora u mre11-2 mutantnoj liniji Arabidopsis thaliana (L.) nakon indukcije dvolančanih lomova DNA Bleomicinom
Pristup korisnicima matične ustanove
diplomski rad
Ekspresija gena staničnog odgovora u mre11-2 mutantnoj liniji Arabidopsis thaliana (L.) nakon indukcije dvolančanih lomova DNA Bleomicinom
Split: Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2016. urn:nbn:hr:166:035137
Rakušić, Mia
Sveučilište u Splitu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Odjel za biologiju

Institucijski repozitorij: repozitorij.pmfst.unist.hr

Citirajte ovaj rad

Rakušić, M. (2016). Ekspresija gena staničnog odgovora u mre11-2 mutantnoj liniji Arabidopsis thaliana (L.) nakon indukcije dvolančanih lomova DNA Bleomicinom (Diplomski rad). Split: Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:035137

Rakušić, Mia. "Ekspresija gena staničnog odgovora u mre11-2 mutantnoj liniji Arabidopsis thaliana (L.) nakon indukcije dvolančanih lomova DNA Bleomicinom." Diplomski rad, Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2016. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:035137

Rakušić, Mia. "Ekspresija gena staničnog odgovora u mre11-2 mutantnoj liniji Arabidopsis thaliana (L.) nakon indukcije dvolančanih lomova DNA Bleomicinom." Diplomski rad, Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2016. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:035137

Rakušić, M. (2016). 'Ekspresija gena staničnog odgovora u mre11-2 mutantnoj liniji Arabidopsis thaliana (L.) nakon indukcije dvolančanih lomova DNA Bleomicinom', Diplomski rad, Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 26.12.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:035137

Rakušić M. Ekspresija gena staničnog odgovora u mre11-2 mutantnoj liniji Arabidopsis thaliana (L.) nakon indukcije dvolančanih lomova DNA Bleomicinom [Diplomski rad]. Split: Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2016 [pristupljeno 26.12.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:035137

M. Rakušić, "Ekspresija gena staničnog odgovora u mre11-2 mutantnoj liniji Arabidopsis thaliana (L.) nakon indukcije dvolančanih lomova DNA Bleomicinom", Diplomski rad, Sveučilište u Splitu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Split, 2016. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:035137

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:166:035137
Podaci o radu
NaslovEkspresija gena staničnog odgovora u mre11-2 mutantnoj liniji Arabidopsis thaliana (L.) nakon indukcije dvolančanih lomova DNA Bleomicinom
Naslov (engleski)Expression of damage response genes in mre11-2 mutant line of Arabidopsis thaliana (L.) after inducing DNA double strand breaks with Bleomycin treatment
AutorMia Rakušić
MentorIvica Šamanić (mentor)
MentorJasna Puizina (mentor)
Član povjerenstvaIvica Šamanić (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaJasna Puizina (član povjerenstva)
Član povjerenstvaŽeljana Fredotović (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Splitu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Odjel za biologiju)
Split
Datum i država obrane2016-09-22, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Biologija
Sažetak
Protein Mre11, u okviru kompleksa Mre11-Rad50-Nbs1/Xrs2 (MRN/X), ima važnu ulogu u popravcima dvolančanih lomova DNA svih do sada istraživanih organizama, od bakterija do čovjeka. U cilju istraživanja te specifične uloge proteina Mre11 u biljne modelne vrste Arabidopsis thaliana (L.), uspoređena je ekspresija gena MRE11 i drugih gena staničnog odgovora, nakon izazivanja dvolančanih lomova DNA bleomicinom. Usporedna analiza ekspresije ciljanih gena urađena je kod mutantne liniji mre11-2 s insercijom T-DNA u 19. egzonu i kod biljaka divljeg tipa, ekotipova Columbia [Col-0] i Wassilewskija [Ws]. Metodom RT-PCR ukupna biljna RNA prevedena je u cDNA koja je poslužila kao kalup za umnažanje gena metodom PCR. Umnoženi geni su potom naneseni na agarozni gel kako bi se mogla odrediti približna ekspresija tih gena kod različitih uzoraka. U mutanata mre11-2 tretiranih bleomicinom rezultati RT-PCR-a pokazali su smanjenu transkripciju gena CYCB1;1, biljega faze G2/M staničnog ciklusa, te gena ključnih za popravak DNA (BRCA1, RAD51, PARP1), za razliku od povećane ekspresije tih gena kod biljaka divljeg tipa. Ekotipovi Columbia i Wassilewskija pokazuju podudaran obrazac ekspresije gena staničnog odgovora. Smanjena ekspresija gena staničnog odgovora u mutantnoj liniji Atmre11-2 potvrđuju važnost cjelovitosti Mre11 proteina za normalni odgovor stanice na dvolančane lomove DNA.
Sažetak (engleski)
Mre11 protein, a part of the MRE11-RAD50-Nbs1/Xrs2 (MRN/X) complex, plays an important role in the repair of DNA double strand breaks in all organisms studied so far, from bacteria to human. In order to investigate this specific role of MRE11 in plant model species Arabidopsis thaliana (L.), we compared the expression of MRE11 gene and other DNA damage response genes, after DSB induction by bleomycin treatment. For comparison, we performed an analogous expression analysis in the mre11-2 mutant line with T-DNA insertion in the 19th exon and in the wild type ecotypes Columbia [Col-0] and Wassilewskija [Ws]. Using RT-PCR, total plant RNAs were transformed into cDNA, which served as a template for PCR gene amplification. These genes are then loaded into an agarose gel to determine the gene expression in various samples. In bleomycin treated mre11-2 mutant, RT-PCR showed reduced transcription of G2/M-specific CYCB1;1 marker gene and key DNA damage repair genes (BRCA1, RAD51, PARP1) in contrast with the increased expression of these genes in wild plants. Columbia and Wassilewskija ecotypes showed similar expression of genes involved in cellular stress response. Expression of DNA damage response genes in the Atmre11-2 mutant line confirms the importance of full length Mre11 protein for normal cell response to DNA double strand breaks.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:166:035137
Studijski programNaziv: Biologija i kemija; smjerovi: nastavnički
Smjer: nastavnički
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/magistra edukacije biologije i kemije (mag. educ. biol. et chem.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaPristup korisnicima matične ustanove
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2017-05-19 15:31:06