Energetsko tržište mora biti uređeno; moraju postojati pravila ustroja i pravila ponašanja subjekata. Hrvatska energetska regulatorna agencija osnovana je 2004. godine Zakonom o regulaciji energetskih djelatnosti kao regulator energetskog sektora. Ona je neovisna regulatorna agencija za mrežne industrije koja osigurava slobodno djelovanje tržišta i ravnopravno djelovanje svih subjekata u njemu te ima ovlast donošenja propisa i podzakonskih akata. HERA kao i ostale neovisne regulatorne agencije ima specifičan položaj u sustavu upravnog odlučivanja. Protiv pojedinačnih akata koje Agencija donosi žalba je u upravnom postupku u pravilu isključena, a drugostupanjskih tijela nema. Budući je upravni nadzor nad njenim radom posebnim zakonima isključen, odnosno nema drugih tijela koja bi bila za to ovlaštena, postavlja se pitanje na koji na način kontrolirati akte koje ona donosi, odnosno kako osigurati djelotvoran sudski nadzor nad njenim radom. Upravni spor je najistaknutiji oblik sudskog nadzora zakonitosti upravnih akata, a koji je zajamčen Ustavom Republike Hrvatske. Sudska kontrola pojedinačnih akata HERA-e omogućena je kroz upravni spor od strane upravnih sudova prvoga stupnja i Visokog upravnog suda, kao suda drugog stupnja, zatim kroz izvanredno preispitivanje zakonitosti pravomoćne presude i rješenja upravnog suda ili Visokog upravnog suda Republike Hrvatske za koje je nadležan Vrhovni sud Republike Hrvatske. Kao posebni institut kontrole ustavnosti pojedinačnih akata je ustavna tužba za čije rješavanje je nadležan Ustavni sud Republike Hrvatske. HERA donosi opće akte za čiju je ocjenu ustavnosti nadležan Ustavni sud Republike Hrvatske, dok je Visoki upravni sud nadležan za kontrolu zakonitosti općih akata. Svatko u RH tko smatra da su mu nezakonitim ili nepravilnim radom tijela ugrožena ili povrijeđena ustavna ili zakonska prava i slobode, može podnijeti pritužbu pučkom pravobranitelju. Budući da je RH punopravna članica EU, građanima ili pravnim osobama omogućeno je, u skladu sa Poveljom o temeljnim pravima EU, obraćanje Europskom ombudsmanu ili Europskom sudu za ljudska prava. Isto tako Europski sud pravde ima značajnu ulogu u sudskoj zaštiti. Može se zaključiti da sustav pravne zaštite protiv akata HERA-e i drugih regulatornih agencija, općenito uključuje upravni postupak, upravni spor, ustavnosudsku zaštitu i europske sudove.