prikaz prve stranice dokumenta Procjena efektivne veličine populacije iz vezanih i nevezanih gena
  Preuzmi
PDF 914.15 KB
diplomski rad
Procjena efektivne veličine populacije iz vezanih i nevezanih gena
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Agronomski fakultet, 2019. urn:nbn:hr:204:873108
Došen, Valentina
Sveučilište u Zagrebu
Agronomski fakultet
Opće stočarstvo

Institucijski repozitorij: Repozitorij Agronomskog fakulteta u Zagrebu

Citirajte ovaj rad

Došen, V. (2019). Procjena efektivne veličine populacije iz vezanih i nevezanih gena (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Agronomski fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:873108

Došen, Valentina. "Procjena efektivne veličine populacije iz vezanih i nevezanih gena." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Agronomski fakultet, 2019. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:873108

Došen, Valentina. "Procjena efektivne veličine populacije iz vezanih i nevezanih gena." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Agronomski fakultet, 2019. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:873108

Došen, V. (2019). 'Procjena efektivne veličine populacije iz vezanih i nevezanih gena', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Agronomski fakultet, citirano: 25.11.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:873108

Došen V. Procjena efektivne veličine populacije iz vezanih i nevezanih gena [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Agronomski fakultet; 2019 [pristupljeno 25.11.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:873108

V. Došen, "Procjena efektivne veličine populacije iz vezanih i nevezanih gena", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Agronomski fakultet, Zagreb, 2019. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:873108

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:873108
Podaci o radu
NaslovProcjena efektivne veličine populacije iz vezanih i nevezanih gena
Naslov (engleski)Estimation of effective population's size by linked and unlinked genes
AutorValentina Došen
MentorMaja Ferenčaković (mentor)
Član povjerenstvaMaja Ferenčaković (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaVlatka Čubrić Čurik (član povjerenstva)
Član povjerenstvaIno Čurik (član povjerenstva)
Član povjerenstvaVladimir Brajković (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Agronomski fakultet
(Opće stočarstvo)
Zagreb
Datum i država obrane2019-09-30, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		BIOTEHNIČKE ZNANOSTI
Poljoprivreda (agronomija)
Sažetak
Efektivna veličina populacije (Ne) predstavlja ključni parametar u populacijskoj genetici koji opisuje količinu genetskog drifta u populaciji. Drugim riječima, Ne je definirana kao veličina hipotetski idealne populacije (N) koja bi doživjela istu količinu genetske promjene, tj. isti iznos genetskog drifta, kao realna populacija koju razmatramo. Procjena Ne putem metode disekvilibrijuma vezanih gena (eng. "linkage disequilibrium" - LD) sve se češće koristi u procjeni parametara populacije. Međutim, ova procjena, zbog specifičnosti formule, uključuje i markere koji nisu vezani, već se samo nalaze u korelaciji (eng. "gametic disequilibrium" - GD). Procjena Ne putem metode disekvilibrijuma vezanih markera (NeLD) često se koristi u populacijskoj genetici ljudi i domaćih životinja. Suprotno, procjena Ne iz informacije disekvilibrijuma nevezanih markera (NeGD) često se koristi u populacijskoj genetici divljih životinja.Ovim radom nastojat će se odvojiti GD i LD i na taj način usporediti procjene Ne s i bez GD-a. Cilj ovog rada je procijeniti Ne programskim paketima NeEstimator i SNeP. Procjene će se potom usporediti budući da ovi programski paketi djeluju na različitim algoritmima. U radu se koriste podaci šest populacija ovaca s ukupnim brojem od 354 jedinke.
Sažetak (engleski)
Effective population size (Ne) is a key population genetic parametar that describes the amount of genetic drift in a population. In other words, Ne is defined as the size of a hypothetically ideal population (N) that would experience the same amount of genetic change (genetic drift) as the real population we are considering. Estimation of effective population size (Ne) by the linkage disequilibrium (LD) method is increasingly used to estimation of population's parameters. However, due to the specificity of the formula, this assessment also includes markers that are not linked but only correlated (gametic disequilibrium – GD). Estimation of Ne by disequilibrium linked marker (NeLD) method is often used in population genetics of humans and domestic animals. On the contrary, the estimation of Ne from disequiliubrium unlinked markers information (NeGD) is often used in genetics of wild animals. This paper will seek to separate GD and LD and thus compare the estimates Ne with and without GD. The aim of this paper is to estimate Ne by programs NeEstimator and SNeP. The estimates will then be compared because programs run on different algorithms. The paper uses data from six sheep populations with a total of 354 individuals.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:204:873108
Studijski programNaziv: Genetika i oplemenjivanje životinja
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/ magistra inženjer/inženjerka genetike i oplemenjivanja životinja (mag. ing. agr.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaOtvoreni pristup
Datum isteka embarga: 2020-11-19
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2019-11-19 07:25:48