prikaz prve stranice dokumenta Procjena i usporedba raznolikosti različitih populacija kokoši putem genomske informacije
Pristup korisnicima matične ustanove
diplomski rad
Procjena i usporedba raznolikosti različitih populacija kokoši putem genomske informacije
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Agronomski fakultet, 2020. urn:nbn:hr:204:884806
Jurić, Tea
Sveučilište u Zagrebu
Agronomski fakultet
Opće stočarstvo

Institucijski repozitorij: Repozitorij Agronomskog fakulteta u Zagrebu

Citirajte ovaj rad

Jurić, T. (2020). Procjena i usporedba raznolikosti različitih populacija kokoši putem genomske informacije (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Agronomski fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:884806

Jurić, Tea. "Procjena i usporedba raznolikosti različitih populacija kokoši putem genomske informacije." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Agronomski fakultet, 2020. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:884806

Jurić, Tea. "Procjena i usporedba raznolikosti različitih populacija kokoši putem genomske informacije." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Agronomski fakultet, 2020. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:884806

Jurić, T. (2020). 'Procjena i usporedba raznolikosti različitih populacija kokoši putem genomske informacije', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Agronomski fakultet, citirano: 20.12.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:884806

Jurić T. Procjena i usporedba raznolikosti različitih populacija kokoši putem genomske informacije [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Agronomski fakultet; 2020 [pristupljeno 20.12.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:884806

T. Jurić, "Procjena i usporedba raznolikosti različitih populacija kokoši putem genomske informacije", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Agronomski fakultet, Zagreb, 2020. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:884806

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:884806
Podaci o radu
NaslovProcjena i usporedba raznolikosti različitih populacija kokoši putem genomske informacije
Naslov (engleski)Estimation and comparation of the diversity of different chicken populations through genomic information
AutorTea Jurić
MentorMaja Ferenčaković (mentor)
Član povjerenstvaMaja Ferenčaković (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaVlatka Čubrić Čurik (član povjerenstva)
Član povjerenstvaZlatko Janječić (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Agronomski fakultet
(Opće stočarstvo)
Zagreb
Datum i država obrane2020-09-30, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		BIOTEHNIČKE ZNANOSTI
Poljoprivreda (agronomija)
Sažetak
Kokoši i njihovi proizvodi čine važan udio u prehrani ljudi, a isto tako su pogodan organizam za istraživanje. Postoji velik broj pasmina kokoši koje su rasprostranjene po cijelom svijetu. Današnja tehnologija, SNP-ovi velike gustoće i dostupnost genomske informacije omogućuju lakša i točnija istraživanja genoma. U ovom radu procijenjeni su genetski parametri bitni za procjenu ugroženosti populacije, a to su: inbreeding, efektivna veličina populacije i heterozigotnost. Analiza je napravljena na 37 tradicionalnih nizozemskih pasmina. Za analizu su korišteni programski paketi SAS, R, PLINK, cgaTOH i SNeP. Heterozigotnost varira između pasmina. Od pasmine eikenburger kod koje iznosi 0.016±0.020, do pasmine sumatra 0.559±0.006. Najveće vrijednosti FROH imamo kod izvedenica iz velikih u patuljaste pasmine tzv. „neo-bantams“. Za preciznije izračune heterozigotnosti, FIS koeficijenta i efektivne veličine populacije potrebno je povećati veličinu uzorka za svaku populaciju na 20 jedinki. Procjena FROH zahtijeva prilagodbu zbog specifičnosti genoma kokoši.
Sažetak (engleski)
Chickens and their products make up an important part of human nutrition and are also a suitable organism for research. There are many breeds of chickens that are widespread throughout the world. Today’s technology, high-density SNPs, and the availability of genomic information allow for easier and more accurate genome research. In this paper, the genetic parameters important for the assessment of population vulnerability were assessed, namely: inbreeding, effective population size and heterozygosity. The analysis was made on 37 traditional Dutch breeds. The software packages SAS, R, PLINK, cgaTOH and SNeP were used for the analysis. Heterozygosity varies between breeds. From the Eikenburger breed, which is 0.016 ± 0.020, to the Sumatra breed, it is 0.559 ± 0.006. We have the highest values of FROH in derivatives from large to dwarf breeds, the so-called "Neo-bantams". For more accurate calculations of heterozygosity, FIS coefficient, and effective population size, it is necessary to increase the sample size for each population to 20 individuals. The assessment of FROH requires adjustment due to the specificity of the chicken genome.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:204:884806
Studijski programNaziv: Genetika i oplemenjivanje životinja
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/ magistra inženjer/inženjerka genetike i oplemenjivanja životinja (mag. ing. agr.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaPristup korisnicima matične ustanove
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2020-10-30 11:00:28