prikaz prve stranice dokumenta Genomska procjena inbridinga na temelju markera spolnih kromosoma
  Preuzmi
PDF 1.25 MB
diplomski rad
Genomska procjena inbridinga na temelju markera spolnih kromosoma
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Agronomski fakultet, 2016. urn:nbn:hr:204:231168
Šantek, Martina
Sveučilište u Zagrebu
Agronomski fakultet
Opće stočarstvo

Institucijski repozitorij: Repozitorij Agronomskog fakulteta u Zagrebu

Citirajte ovaj rad

Šantek, M. (2016). Genomska procjena inbridinga na temelju markera spolnih kromosoma (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Agronomski fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:231168

Šantek, Martina. "Genomska procjena inbridinga na temelju markera spolnih kromosoma." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Agronomski fakultet, 2016. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:231168

Šantek, Martina. "Genomska procjena inbridinga na temelju markera spolnih kromosoma." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Agronomski fakultet, 2016. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:231168

Šantek, M. (2016). 'Genomska procjena inbridinga na temelju markera spolnih kromosoma', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Agronomski fakultet, citirano: 25.11.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:231168

Šantek M. Genomska procjena inbridinga na temelju markera spolnih kromosoma [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Agronomski fakultet; 2016 [pristupljeno 25.11.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:231168

M. Šantek, "Genomska procjena inbridinga na temelju markera spolnih kromosoma", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Agronomski fakultet, Zagreb, 2016. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:231168

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:204:231168
Podaci o radu
NaslovGenomska procjena inbridinga na temelju markera spolnih kromosoma
AutorMartina Šantek
MentorIno Čurik (mentor)
Član povjerenstvaIno Čurik (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaMiroslav Kapš (član povjerenstva)
Član povjerenstvaVlatka Čubrić Čurik (član povjerenstva)
Član povjerenstvaMaja Ferenčaković (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Agronomski fakultet
(Opće stočarstvo)
Zagreb
Datum i država obrane2016-09-27, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		BIOTEHNIČKE ZNANOSTI
Poljoprivreda (agronomija)
Genetika i oplemenjivanje bilja, životinja i mikroorganizama
Sažetak
Inbriding, odnosno parenje jedinki u srodstvu se mjeri koeficijentom inbridinga, F. Do vrijednosti koeficijenta inbridinga se može doći na više načina, jedan od kojih je procjena inbridinga pomoću određivanja homozigotnih odsječaka (ROH). Genomski koeficijent inbridinga se obično odnosi na autosome, dok se inbriding na X kromosomu zanemaruje. U ovom radu su određeni ROH-ovi >4 Mb, >8 Mb i >16 Mb kod jedinki populacije Soay ovaca genotipiziranih Ovine 50K SNP čipom te su određene vrijednosti koeficijenata inbridinga za autosome i X kromosom. Za autosome su određene vrijednosti ukupno za sve kromosome te posebno za svaki kromosom. Inbriding na X kromosomu je ~4 do 15 puta veći nego na autosomima, a vrijednosti za autosomalni i X inbriding uvelike razlikuju kod pojedinih jedinki te je korelacija između vrijednosti niska. X inbriding može biti važan kod vrsta kojima veći dio genoma čini X kromosom te kod kojih su neka važna svojstva djelomično određena genima na X kromosomu te stoga ne smije biti zanemarivan.
Sažetak (engleski)
Inbreeding or mating of related individuals is measured by the coefficient of inbreeding, F. There are more ways to calculate the coefficient of inbreeding, one of which is estimating inbreeding with use of homozygous runs (ROHs). Genomic inbreeding coefficient is usually based on the autosomal chromosomes, while the inbreeding on the X chromosome is neglected. In this thesis, ROHs>4 Mb, >8 Mb and >16 Mb are detected in individuals from Soay sheep population genotyped with Ovine 50K SNP chip and coefficients of inbreeding are determined for autosomal chromosomes and X chromosome. In addition, coefficients of inbreeding are determined for every autosomal chromosome, separately. Detected inbreeding on X chromosome is ~4 to 15 times higher than on the autosomal chromosomes, and values for autosomal and X-chromosomal inbreeding differ a lot in individuals and the correlation between two values is low. X inbreeding can be important in species that have most of their genome located on the X chromosome and those who have some important traits partially determined by genes on X chromosome and therefore must not be neglected.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:204:231168
Studijski programNaziv: Genetika i oplemenjivanje životinja
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/ magistra inženjer/inženjerka genetike i oplemenjivanja životinja (mag. ing. agr.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaOtvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2016-11-30 07:21:57