prikaz prve stranice dokumenta De novo sastavljanje genoma koristeći dugačka očitanja s velikom pogreškom
Rad nije dostupan
diplomski rad
De novo sastavljanje genoma koristeći dugačka očitanja s velikom pogreškom
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2016. urn:nbn:hr:168:726447
Kostelac, Mario
Sveučilište u Zagrebu
Fakultet elektrotehnike i računarstva

Institucijski repozitorij: Repozitorij FER-a

Citirajte ovaj rad

Kostelac, M. (2016). De novo sastavljanje genoma koristeći dugačka očitanja s velikom pogreškom (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:726447

Kostelac, Mario. "De novo sastavljanje genoma koristeći dugačka očitanja s velikom pogreškom." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2016. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:726447

Kostelac, Mario. "De novo sastavljanje genoma koristeći dugačka očitanja s velikom pogreškom." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2016. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:726447

Kostelac, M. (2016). 'De novo sastavljanje genoma koristeći dugačka očitanja s velikom pogreškom', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, citirano: 04.11.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:726447

Kostelac M. De novo sastavljanje genoma koristeći dugačka očitanja s velikom pogreškom [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva; 2016 [pristupljeno 04.11.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:726447

M. Kostelac, "De novo sastavljanje genoma koristeći dugačka očitanja s velikom pogreškom", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb, 2016. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:726447

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:726447
Podaci o radu
NaslovDe novo sastavljanje genoma koristeći dugačka očitanja s velikom pogreškom
Naslov (engleski)De Novo Assembly Using Long Error-prone Reads
AutorMario Kostelac
MentorMile Šikić (mentor)
Član povjerenstvaMile Šikić (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaDamir Seršić (član povjerenstva)
Član povjerenstvaMirjana Domazet-Lošo (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Fakultet elektrotehnike i računarstva
Zagreb
Datum i država obrane2016-02-15, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		TEHNIČKE ZNANOSTI
Računarstvo
Sažetak
Sastavljanje genoma koristeći dugačka očitanja s velikom pogreškom (bez ispravljanja očitanja) je obećavajuća metoda. Diplomski rad pokazuje da se, ako se koriste zajedno s jednostavnim metodama za uklanjanje šuma iz podataka, metode korištene za sastavljanje genoma koristeći kratka očitanja mogu koristiti i za sastavljanje genoma koristeći dugačka očitanja. Implementirane metode su testirane na dva skupa podataka E. coli (jedan tvrtke PacBio i jedan tvrtke Oxford Nanopore Technologies). Rezultati su uspoređeni s rezultatima miniasm assemblera.
Sažetak (engleski)
Assembling genomes from long error-prone reads without error correction seems like a promising method. The thesis shows that layout methods used for assembling genomes from short reads can be utilized for assembling from long error-prone reads, if coupled with new methods for eliminating the noise from a dataset. Methods are validated with two datasets of Escherichia coli (PacBio and Oxford Nanopore Technologies). Results are compared with results of the miniasm assembler.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikengleski
URN:NBNurn:nbn:hr:168:726447
Studijski programNaziv: Računarstvo
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/magistra inženjer/inženjerka računarstva (mag.ing.comp.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaZatvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Javna napomena
Datum i vrijeme pohrane2018-02-06 09:47:20