prikaz prve stranice dokumenta Simulacija DNA sljedova korištenjem Gillespiejevog algoritma
Rad nije dostupan
završni rad
Simulacija DNA sljedova korištenjem Gillespiejevog algoritma
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2024. urn:nbn:hr:168:136976
Topolko, Lucija
Sveučilište u Zagrebu
Fakultet elektrotehnike i računarstva

Institucijski repozitorij: Repozitorij FER-a

Citirajte ovaj rad

Topolko, L. (2024). Simulacija DNA sljedova korištenjem Gillespiejevog algoritma (Završni rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:136976

Topolko, Lucija. "Simulacija DNA sljedova korištenjem Gillespiejevog algoritma." Završni rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2024. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:136976

Topolko, Lucija. "Simulacija DNA sljedova korištenjem Gillespiejevog algoritma." Završni rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2024. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:136976

Topolko, L. (2024). 'Simulacija DNA sljedova korištenjem Gillespiejevog algoritma', Završni rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, citirano: 02.12.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:136976

Topolko L. Simulacija DNA sljedova korištenjem Gillespiejevog algoritma [Završni rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva; 2024 [pristupljeno 02.12.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:136976

L. Topolko, "Simulacija DNA sljedova korištenjem Gillespiejevog algoritma", Završni rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb, 2024. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:136976

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:136976
Podaci o radu
NaslovSimulacija DNA sljedova korištenjem Gillespiejevog algoritma
Naslov (engleski)DNA sequence simulation based on Gillespie algorithm
AutorLucija Topolko
MentorMirjana Domazet-Lošo (mentor)
Član povjerenstvaMirjana Domazet-Lošo (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaMihael Kovač (član povjerenstva)
Član povjerenstvaAndrej Slapničar (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Fakultet elektrotehnike i računarstva
Zagreb
Datum i država obrane2024-06-27, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		TEHNIČKE ZNANOSTI
Računarstvo
Sažetak
Simulatori DNA sljedova ključni su alati u molekularnoj biologiji i bioinformatičkom istraživanju jer omogućuju simuliranje kompleksnih evolucijskih procesa kroz generacije. Ovi alati su od velikog značaja za istraživanje genetičke varijabilnosti, evolucijskih trendova i adaptivnih strategija organizama. U ovom radu razvijen je simulator temeljen na Gillespiejevom algoritmu. Gillespiejev algoritam predstavlja matematičku metodu za simulaciju stohastičkih procesa u biološkim sustavima. Ovaj simulator omogućava simulaciju DNA sljedova koristeći Jukes-Cantorov i Kimurin evolucijski model. Implementiran je u programskom jeziku C++, a testiran je na podacima virusa HIV-1. Rezultati su uspoređeni s rezultatima alata AliSim kako bi se provjerila njegova učinkovitost i pouzdanost.
Sažetak (engleski)
DNA sequence simulators are key tools in molecular biology and bioinformatics research, as they enable the simulation of complex evolutionary processes across generations. These tools hold significant importance for studying genetic variability, evolutionary trends, and adaptive strategies of organisms. In this study, a simulator based on the Gillespie algorithm was developed. The Gillespie algorithm is a mathematical method for simulating stochastic processes in biological systems. This simulator allows for the simulation of DNA sequences using the Jukes-Cantor and Kimura evolutionary models. It was implemented in the programming language C++ and tested using HIV-1 virus data. The results were compared with those of the AliSim tool to verify its effectiveness and reliability.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:168:136976
Studijski programNaziv: Računarstvo
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: preddiplomski
Akademski / stručni naziv: sveučilišni/a prvostupnik/ prvostupnica (baccalaureus/baccalaurea) inženjer/inženjerka računarstva (univ.bacc.ing.comp.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaZatvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Javna napomena
Datum i vrijeme pohrane2024-10-12 22:21:34