prikaz prve stranice dokumenta Određivanje preklapanja među očitanjima u postupku de novo sastavljanja genoma
Rad nije dostupan
završni rad
Određivanje preklapanja među očitanjima u postupku de novo sastavljanja genoma
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2016. urn:nbn:hr:168:239692
Široki, Tin
Sveučilište u Zagrebu
Fakultet elektrotehnike i računarstva

Institucijski repozitorij: Repozitorij FER-a

Citirajte ovaj rad

Široki, T. (2016). Određivanje preklapanja među očitanjima u postupku de novo sastavljanja genoma (Završni rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:239692

Široki, Tin. "Određivanje preklapanja među očitanjima u postupku de novo sastavljanja genoma." Završni rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2016. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:239692

Široki, Tin. "Određivanje preklapanja među očitanjima u postupku de novo sastavljanja genoma." Završni rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2016. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:239692

Široki, T. (2016). 'Određivanje preklapanja među očitanjima u postupku de novo sastavljanja genoma', Završni rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, citirano: 27.11.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:239692

Široki T. Određivanje preklapanja među očitanjima u postupku de novo sastavljanja genoma [Završni rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva; 2016 [pristupljeno 27.11.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:239692

T. Široki, "Određivanje preklapanja među očitanjima u postupku de novo sastavljanja genoma", Završni rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb, 2016. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:239692

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:239692
Podaci o radu
NaslovOdređivanje preklapanja među očitanjima u postupku de novo sastavljanja genoma
Naslov (engleski)Finding overlapping reads for de novo genome assembly
AutorTin Široki
MentorMirjana Domazet-Lošo (mentor)
Član povjerenstvaMirjana Domazet-Lošo (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaMario Brčić (član povjerenstva)
Član povjerenstvaMarina Ptiček (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Fakultet elektrotehnike i računarstva
Zagreb
Datum i država obrane2016-07-11, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		TEHNIČKE ZNANOSTI
Računarstvo
Sažetak
Određivanje preklapanja je prvi korak de novo sastavljanja genoma metodom preklapanje-razmještaj-konsenzus . Za određivanje preklapanja koristio sam kombinirani pristup. Pristup koristi prošireno sufiksno polje za pronalazak identičnih preklapanja i dinamičko programiranje za poravnanje dijelova očitanja između identičnih preklapanja. Ovakav način određivanja preklapanja omogućava kompromis između kvalitete određenih preklapanja i vremena izvođenja.
Sažetak (engleski)
Finding overlaps is the first step of de novo genome assembly using Overlap-Layout-Consensus method. To determine overlaps I used a combined approach. The approach uses enhanced suffix array for finding identical overlaps and dynamic programming to align parts of reads between identical overlaps. This method allows a trade off between the quality of determined overlaps and runtime.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:168:239692
Studijski programNaziv: Računarstvo
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: preddiplomski
Akademski / stručni naziv: sveučilišni/a prvostupnik/ prvostupnica (baccalaureus/baccalaurea) inženjer/inženjerka računarstva (univ.bacc.ing.comp.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaZatvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Javna napomena
Datum i vrijeme pohrane2018-02-06 12:18:13