prikaz prve stranice dokumenta Algoritmi za utvrđivanje fleksibilnosti proteina na temelju konformacije i fizikalnih svojstava proteina
Rad nije dostupan
disertacija
Algoritmi za utvrđivanje fleksibilnosti proteina na temelju konformacije i fizikalnih svojstava proteina
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2008. urn:nbn:hr:168:483110
Šikić, Krešimir
Sveučilište u Zagrebu
Fakultet elektrotehnike i računarstva
Zavod za elektroničke sustave i obradbu informacija
Institut Ruđer Bošković

Institucijski repozitorij: Repozitorij FER-a

Citirajte ovaj rad

Šikić, K. (2008). Algoritmi za utvrđivanje fleksibilnosti proteina na temelju konformacije i fizikalnih svojstava proteina (Disertacija). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva; Zagreb: Institut Ruđer Bošković. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:483110

Šikić, Krešimir. "Algoritmi za utvrđivanje fleksibilnosti proteina na temelju konformacije i fizikalnih svojstava proteina." Disertacija, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva; Institut Ruđer Bošković, 2008. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:483110

Šikić, Krešimir. "Algoritmi za utvrđivanje fleksibilnosti proteina na temelju konformacije i fizikalnih svojstava proteina." Disertacija, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva; Institut Ruđer Bošković, 2008. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:483110

Šikić, K. (2008). 'Algoritmi za utvrđivanje fleksibilnosti proteina na temelju konformacije i fizikalnih svojstava proteina', Disertacija, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva; Institut Ruđer Bošković, citirano: 04.11.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:483110

Šikić K. Algoritmi za utvrđivanje fleksibilnosti proteina na temelju konformacije i fizikalnih svojstava proteina [Disertacija]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva; Zagreb: Institut Ruđer Bošković; 2008 [pristupljeno 04.11.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:483110

K. Šikić, "Algoritmi za utvrđivanje fleksibilnosti proteina na temelju konformacije i fizikalnih svojstava proteina", Disertacija, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb; Institut Ruđer Bošković, Zagreb, 2008. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:483110

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:483110
Podaci o radu
NaslovAlgoritmi za utvrđivanje fleksibilnosti proteina na temelju konformacije i fizikalnih svojstava proteina
Naslov (engleski)Algorithms for determination of protein flexibility based on conformations and physical properties of protein
AutorKrešimir Šikić
MentorBranko Jeren (mentor)
MentorSanja Tomić (komentor)
Član povjerenstvaSven Lončarić (član povjerenstva)
Član povjerenstvaBranko Jeren (član povjerenstva)
Član povjerenstvaSanja Tomić (član povjerenstva)
Član povjerenstvaMladen Kos (član povjerenstva)
Član povjerenstvaDavor Petrinović (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Fakultet elektrotehnike i računarstva
(Zavod za elektroničke sustave i obradbu informacija)
Zagreb
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Institut Ruđer Bošković
Zagreb
Datum i država obrane2008-09-29, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		TEHNIČKE ZNANOSTI
Elektrotehnika
Elektronika
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		TEHNIČKE ZNANOSTI
Računarstvo
Obradba informacija
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		INTERDISCIPLINARNA PODRUČJA ZNANOSTI
Biotehnologija u biomedicini (prirodno područje, biomedicina i zdravstvo, biotehničko područje)
Univerzalna decimalna klasifikacija
(UDC)		621.3 - Elektrotehnika
60 - Biotehnologija. Genetičko inženjerstvo. Produkti kloniranja
Sažetak
Tema ovog rada je proučavanje fleksibilnosti proteina. U cilju proučavanja fleksibilnosti proteina u radu su predložene dvije nove metode za utvrđivanje fleksibilnosti. Metode su apriori i aposteriori. Prva metoda identificira fleksibilne i rigidne domene u proteinu na temelju karakteristika jednog prostornog oblika korištenjem kompleksnih modela i aproksimacija. Druga metoda se temelji na usporedbi dvaju prostornih oblika istog proteina. Prva metoda je točnija iz razloga što uzima u razmatranje dva prostorna oblika, ali nije uvijek upotrebljiva. Druga metoda se može uvijek primijeniti jer zahtijeva samo jedan prostorni oblik. Usporedbom rezultata dobivenih korištenjem ovih metoda dokazano je da je apriori dovoljno točna kako bi se mogla koristiti u budućim istraživanjima. Temeljem apostreriori metode napravljen je testni skup koji je moguće koristiti za testiranje novih metoda za određivanje fleksibilnosti. Kako obradba informacija u ovom radu ovisi o PDB zapisima napravljena je i sveobuhvatna usporedba PDB zapisa dobivenih različitim tehnikama. Na ovaj način su utvrđene razlike u zapisima koje mogu utjecati na istraživanja.
Sažetak (engleski)
This thesis is focused on studying protein flexibility. For that purpose two new methods for protein flexibility identification based on information processing have been proposed. Methods are named apriori and aposteriori. First method identifies flexible and rigid domains in protein on a basis of single conformation properties using complex models and approximations. Second method relies on comparison of two conformations of the same protein. However, I consider first method to be more accurate one but due to its limitations (two conformations required) it is not always applicable, while second method requiring only one conformation can always be applied. By comparing results obtained with these methods I have proofed that the accuracy of the apriori is high enough to be use in future studies. Also using proposed aposteriori a limited size benchmark for the purpose of developing future methods has been created. As information processing in this thesis relies on PDB entries a large scale comparison between different types of entries has been done in order to determine differences and possible pitfalls in the research.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:168:483110
Studijski programNaziv: Elektrotehnika i računarstvo
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: poslijediplomski doktorski
Akademski / stručni naziv: Doktor znanosti elektrotehnike i računarstva (dr.sc.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaZatvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2020-05-26 06:24:20