prikaz prve stranice dokumenta Učinkovito sažimanje genoma korištenjem referentnog genoma
Rad nije dostupan
diplomski rad
Učinkovito sažimanje genoma korištenjem referentnog genoma
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2021. urn:nbn:hr:168:245331
Radanović, Juraj
Sveučilište u Zagrebu
Fakultet elektrotehnike i računarstva

Institucijski repozitorij: Repozitorij FER-a

Citirajte ovaj rad

Radanović, J. (2021). Učinkovito sažimanje genoma korištenjem referentnog genoma (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:245331

Radanović, Juraj. "Učinkovito sažimanje genoma korištenjem referentnog genoma." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2021. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:245331

Radanović, Juraj. "Učinkovito sažimanje genoma korištenjem referentnog genoma." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, 2021. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:245331

Radanović, J. (2021). 'Učinkovito sažimanje genoma korištenjem referentnog genoma', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, citirano: 23.11.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:245331

Radanović J. Učinkovito sažimanje genoma korištenjem referentnog genoma [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva; 2021 [pristupljeno 23.11.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:245331

J. Radanović, "Učinkovito sažimanje genoma korištenjem referentnog genoma", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb, 2021. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:245331

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:168:245331
Podaci o radu
NaslovUčinkovito sažimanje genoma korištenjem referentnog genoma
Naslov (engleski)Efficient referential genome compression
AutorJuraj Radanović
MentorMirjana Domazet-Lošo (mentor)
Član povjerenstvaMirjana Domazet-Lošo (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaKrešimir Fertalj (član povjerenstva)
Član povjerenstvaIvica Botički (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Fakultet elektrotehnike i računarstva
Zagreb
Datum i država obrane2021-07-06, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		TEHNIČKE ZNANOSTI
Računarstvo
Sažetak
U ovom radu sam implementirao SCCG algoritam za kompresiju genoma koristeći referentni genom. Referentni genom pomaže u boljoj kompresiji ciljnog genoma. Objašnjeni su glavni koncepti algoritma kao što su lokalno i globalno pretraživanje, hash mape, parametri algoritma. U radu su prikazani rezultati algoritma na nekoliko genoma te usporedbu s originalnom implementacijom i usporedbu lokalnog i globalnog pretraživanja. Također je prikazan utjecaj parametara na kompresiju kromosoma ljudskog genoma
Sažetak (engleski)
In this thesis I implemented the SCCG algorithm for genome compression using a referential genome. The referential genome allows the target genome to achieve better compression. The core concepts of the algorithm are explained, such as local and global searching, hash maps, algorithm parameters. A sample of genomes were used to test the algorithm and compare it to the original, as well as a comparison between local and global searching. Also, different parameters were used to test the compression on a chromosome of a human genome.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:168:245331
Studijski programNaziv: Računarstvo
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/magistra inženjer/inženjerka računarstva (mag.ing.comp.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaZatvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Javna napomena
Datum i vrijeme pohrane2023-01-13 15:59:10