prikaz prve stranice dokumenta Identification and characterization of catalytically important residues in the active site of human GDP-fucose synthase
Rad nije dostupan
diplomski rad
Identification and characterization of catalytically important residues in the active site of human GDP-fucose synthase
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prehrambeno-biotehnološki fakultet, 2022. urn:nbn:hr:159:527952
Kastner, Klara
Sveučilište u Zagrebu
Prehrambeno-biotehnološki fakultet
Zavod za biokemijsko inženjerstvo
Laboratorij za biokemijsko inženjerstvo, industrijsku mikrobiologiju i tehnologiju piva i slada

Institucijski repozitorij: Repozitorij Prehrambeno-biotehnološkog fakulteta u Zagrebu

Citirajte ovaj rad

Kastner, K. (2022). Identification and characterization of catalytically important residues in the active site of human GDP-fucose synthase (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prehrambeno-biotehnološki fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:159:527952

Kastner, Klara. "Identification and characterization of catalytically important residues in the active site of human GDP-fucose synthase." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prehrambeno-biotehnološki fakultet, 2022. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:159:527952

Kastner, Klara. "Identification and characterization of catalytically important residues in the active site of human GDP-fucose synthase." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prehrambeno-biotehnološki fakultet, 2022. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:159:527952

Kastner, K. (2022). 'Identification and characterization of catalytically important residues in the active site of human GDP-fucose synthase', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prehrambeno-biotehnološki fakultet, citirano: 22.01.2025., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:159:527952

Kastner K. Identification and characterization of catalytically important residues in the active site of human GDP-fucose synthase [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prehrambeno-biotehnološki fakultet; 2022 [pristupljeno 22.01.2025.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:159:527952

K. Kastner, "Identification and characterization of catalytically important residues in the active site of human GDP-fucose synthase", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prehrambeno-biotehnološki fakultet, Zagreb, 2022. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:159:527952

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:159:527952
Podaci o radu
NaslovIdentification and characterization of catalytically important residues in the active site of human GDP-fucose synthase
Naslov (hrvatski)Identifikacija i karakterizacija važnih aminokiselina u aktivnom mjestu humane GDP-fukoza sintaze
AutorKlara Kastner
MentorAnita Slavica (mentor)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prehrambeno-biotehnološki fakultet
(Zavod za biokemijsko inženjerstvo)
(Laboratorij za biokemijsko inženjerstvo, industrijsku mikrobiologiju i tehnologiju piva i slada)
Zagreb
Datum i država obrane2022-01-28, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		BIOTEHNIČKE ZNANOSTI
Biotehnologija
Sažetak
Human GDP-fucose synthase (hGFS) catalyzes three distinct reactions within a single active site: two epimerizations and one reduction. Wild-type hGFS and 11 targeted mutants (C116S, C116A, C116D, H189N, H189D, Y143F, K149A, S114A, N79A, N140A, K282A) were designed for identification and characterization of important residues. Mutants C116A, C116D and H189D do not possess activity towards the substrate, which indicates importance of those residues in the epimerization reactions. Based on the obtained kinetic parameters, N140A mutant seems to be involved in binding and positioning of the substrate. Km value of K282A mutant (482.3 mmol Lˉ¹) indicates that this residue is possibly employed in the substrate binding. Mutants C116S and N140A generate additional product (presumably GDP-Alt). Reaction sequence in the active site of the hGFSs was assessed by following production of deuterated compounds (GDP-4k6d-Man and GDP-Fuc). First epimerization reaction occurs at C-3”, the second one at C-5”, and subsequently the reduction at C-4”.
Sažetak (engleski)
Humana GDP-fukoza sintaza (hGFS) katalizira tri različite reakcije u jednom aktivnom mjestu: dvije epimerizacije i jednu redukciju. Divlji tip hGFS i 11 ciljanih mutanata (C116S, C116A, C116D, H189N, H189D, Y143F, K149A, S114A, N79A, N140A, K282A) je dizajnirano za identifikaciju i karakterizaciju važnih aminokiselina. Mutanti C116A, C116D i H189D ne iskazuju aktivnost prema supstratu, što bi moglo ukazivati na važnost ovih aminokiselina u reakcijama epimerizacija. Na temelju dobivenih kinetičkih parametara može se zaključiti da je mutant N140A uključen u vezanje i pozicioniranje supstrata u aktivnom mjestu. Km vrijednost mutanta K282A (482.3 mmol Lˉ¹) ukazuje da je ova aminokiselina možda uključena u vezanje supstrata u aktivno mjesto enzima. Mutanti C116S i N140A proizvode dodatni produkt (pretpostavlja se GDP-Alt). Redoslijed reakcija u aktivnom mjestu svih hGFS predložen je na temelju nastanka deuteriranih spojeva (GDP-4k6d-Man i GDP-Fuc). Prva epimerizacija odvija se na C-3”, druga epimerizacija na C-5”, a slijedeća je reakcija redukcije na C-4”.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikengleski
URN:NBNurn:nbn:hr:159:527952
Studijski programNaziv: Bioprocesno inženjerstvo
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/magistra inženjer/inženjerka bioprocesnog inženjerstva (mag. ing. bioproc.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaZatvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2022-05-26 12:51:04