prikaz prve stranice dokumenta In silico karakterizacija metagenomskih alkan 1-monooksigenaza
Pristup korisnicima matične ustanove
diplomski rad
In silico karakterizacija metagenomskih alkan 1-monooksigenaza
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prehrambeno-biotehnološki fakultet, 2015. urn:nbn:hr:159:068577
Oršolić, Davor
Sveučilište u Zagrebu
Prehrambeno-biotehnološki fakultet
Zavod za biokemijsko inženjerstvo
Kabinet za bioinformatiku

Institucijski repozitorij: Repozitorij Prehrambeno-biotehnološkog fakulteta u Zagrebu

Citirajte ovaj rad

Oršolić, D. (2015). In silico karakterizacija metagenomskih alkan 1-monooksigenaza (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prehrambeno-biotehnološki fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:159:068577

Oršolić, Davor. "In silico karakterizacija metagenomskih alkan 1-monooksigenaza." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prehrambeno-biotehnološki fakultet, 2015. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:159:068577

Oršolić, Davor. "In silico karakterizacija metagenomskih alkan 1-monooksigenaza." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prehrambeno-biotehnološki fakultet, 2015. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:159:068577

Oršolić, D. (2015). 'In silico karakterizacija metagenomskih alkan 1-monooksigenaza', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prehrambeno-biotehnološki fakultet, citirano: 25.12.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:159:068577

Oršolić D. In silico karakterizacija metagenomskih alkan 1-monooksigenaza [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prehrambeno-biotehnološki fakultet; 2015 [pristupljeno 25.12.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:159:068577

D. Oršolić, "In silico karakterizacija metagenomskih alkan 1-monooksigenaza", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prehrambeno-biotehnološki fakultet, Zagreb, 2015. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:159:068577

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:159:068577
Podaci o radu
NaslovIn silico karakterizacija metagenomskih alkan 1-monooksigenaza
Naslov (engleski)In silico characterisation of metagenomic alkane 1-monooxygenases
AutorDavor Oršolić
MentorJurica Žučko (mentor)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prehrambeno-biotehnološki fakultet
(Zavod za biokemijsko inženjerstvo)
(Kabinet za bioinformatiku)
Zagreb
Datum i država obrane2015-09-28, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		BIOTEHNIČKE ZNANOSTI
Biotehnologija
Sažetak
Cilj istraživanja bio je provesti filogenetsku analizu, funkcionalnu karakterizaciju i trodimenzionalno strukturno modeliranje hipotetskih alkan monooksigenaza iz metagenomske knjižnice sastavljene iz umjereno onečišćenog uzorka sakupljenog iz sedimenta lučnog sidrišta u Puli. Filogenetska analiza provedena je s pomoću MEGA programa, te je dala hipotetski prikaz evolucijske povezanosti između proteina. Funkcionalnom karakterizacijom putem UniProt, InterPro i CD baze podataka potvrđena je pripadnost ispitivanih proteina alkan 1-monooksigenazama, dok strukturno modeliranje s pomoću SWISS-MODEL i I-TASSER web servisa nisu dali značajne rezultate niti za jedan od proteina. Neuspjelost strukturnog modeliranja pripisana je nedostatku homolognih proteina s eksperimentalno određenom trodimenzionalnom strukturom.
Sažetak (engleski)
Phylogenetic analysis, functional characterization and structural modeling of putative alkan monooxygenases from metagenomic library constructed from a moderately polluted sample collected from a tanker berth station in Pula was performed. Phylogenetic analysis conducted via MEGA software resulted in phylogenetic tree representing hypothesis of evolutionary relationships between proteins. Functional characterization using UniProt, InterPro and CDD search engines confirmed similarities between putative proteins and alkan 1-monooxygenases, while structural modeling via SWISS-MODEL and I-TASSER server didn't give significant results. Inefficiency of structural modeling was attributed to absence of homologous proteins with experimentally determined three-dimensional structure.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:159:068577
Studijski programNaziv: Molekularna biotehnologija
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/magistra inženjer/inženjerka molekularne biotehnologije (mag. ing. biotechn.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaPristup korisnicima matične ustanove
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2017-04-28 12:40:09