prikaz prve stranice dokumenta Istraživanje interakcija klaritromicina i ribosoma izoliranog iz bakterije Escherichia coli spektroskopijom NMR
  Preuzmi
PDF 3.92 MB
diplomski rad
Istraživanje interakcija klaritromicina i ribosoma izoliranog iz bakterije Escherichia coli spektroskopijom NMR
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2021. urn:nbn:hr:217:714511
Tkalčević, Mateja
Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Kemijski odsjek

Institucijski repozitorij: Repozitorij Prirodoslovno-matematičkog fakulteta

Citirajte ovaj rad

Tkalčević, M. (2021). Istraživanje interakcija klaritromicina i ribosoma izoliranog iz bakterije Escherichia coli spektroskopijom NMR (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:714511

Tkalčević, Mateja. "Istraživanje interakcija klaritromicina i ribosoma izoliranog iz bakterije Escherichia coli spektroskopijom NMR." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2021. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:714511

Tkalčević, Mateja. "Istraživanje interakcija klaritromicina i ribosoma izoliranog iz bakterije Escherichia coli spektroskopijom NMR." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2021. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:714511

Tkalčević, M. (2021). 'Istraživanje interakcija klaritromicina i ribosoma izoliranog iz bakterije Escherichia coli spektroskopijom NMR', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 06.01.2025., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:714511

Tkalčević M. Istraživanje interakcija klaritromicina i ribosoma izoliranog iz bakterije Escherichia coli spektroskopijom NMR [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2021 [pristupljeno 06.01.2025.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:714511

M. Tkalčević, "Istraživanje interakcija klaritromicina i ribosoma izoliranog iz bakterije Escherichia coli spektroskopijom NMR", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2021. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:714511

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:714511
Podaci o radu
NaslovIstraživanje interakcija klaritromicina i ribosoma izoliranog iz bakterije Escherichia coli spektroskopijom NMR
Naslov (engleski)Study of interactions between clarithromycin and ribosome isolated from Escherichia coli by NMR spectroscopy
AutorMateja Tkalčević
MentorTomislav Jednačak (mentor)
Član povjerenstvaTomislav Jednačak (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaNikola Bregović (član povjerenstva)
Član povjerenstvaJasmina Rokov Plavec (član povjerenstva)
Član povjerenstvaIvana Biljan (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Kemijski odsjek)
Zagreb
Datum i država obrane2021-09-28, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Kemija
Sažetak
Klaritromicin je predstavnik druge generacije makrolidnih antibiotika, u koju spada i poznatiji azitromicin. Makrolidni antibiotici (makrolidi) se koriste u liječenju infekcija uzrokovanih Gram-pozitivnim i Gram-negativnim bakterijama. Vezanjem za veliku podjedinicu bakterijskog ribosoma makrolidi inhibiraju translaciju proteina čime ubijaju bakterijske stanice. Učestalom primjenom makrolida bakterije su razvile različite mehanizme otpornosti na njihovo djelovanje. Stoga je interes znanosti preusmjeren na razvoj novih makrolidnih antibiotika. Za uspješan dizajn novog makrolida važno je razumjeti njegove interakcije s bakterijskim ribosomom. Stoga je cilj ovog rada okarakterizirati strukturu i interakcije klaritromcina s ribosomom izoliranim iz bakterije Escherichia coli u otopini primjenom jedno- i dvodimenzijskih tehnika NMR. Tehnikama NOESY (engl. nuclear Overhauser effect spectroscopy) i ROESY (engl. rotating frame Overhauser effect spectroscopy) određena je konformacija klaritromicina u slobodnom stanju, a pomoću prijenosnog NOESY određena je konformacija vezanog klaritromicina. Nadalje, metodom STD (engl. saturation transfer difference) proučene su interakcije klaritromicina s ribosomom iz bakterije E. coli i određeni su vezni epitopi.
Sažetak (engleski)
Clarithromycin is a representative of the second generation of macrolide antibiotics, which includes better-known azithromycin. Macrolides are used for treating infections caused by Gram-positive and Gram-negative bacteria. Binding of macrolides to a large subunit of the bacterial ribosome inhibits protein translation and kills bacterial cells. Due to a frequent use of macrolides, bacteria have developed different resistance mechanisms. For this reason, the interest of science has been redirected to the development of new macrolide antibiotics. For a successful design of a new macrolide, it is important to understand its interactions with the bacterial ribosome. Therefore, the purpose of this study is to characterize the structure and interactions of clarithromycin with ribosome isolated from Escherichia coli in solution using one- and two-dimensional NMR techniques. Conformational studies of clarithromycin in the free-state were carried out using NOESY and ROESY techniques, while the bound-state conformation was determined from trNOESY correlations. Furthermore, the interactions of clarithromycin with the E. coli ribosome were studied by STD method, which allowed the assessment of binding epitopes.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:217:714511
ProjektŠifra: IP-2018-01-8098
Naziv: Makrozoni, novi konjugati makrolidnih antibiotika: Dizajn, priprava i interakcije
Naziv: Macrozones, New Conjugates of Macrolide Antibiotics: Design, Synthesis and Interactions
Kratica: Makrozoni/Macrozones
Voditelj: Predrag Novak
Pravna nadležnost: Hrvatska
Financijer: HRZZ
Linija financiranja: IP
Studijski programNaziv: Kemija; smjerovi: istraživački
Smjer: istraživački
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/magistra kemije (mag. chem.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaOtvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2021-10-22 12:19:15