prikaz prve stranice dokumenta Modeliranje stabilnosti heksamernog i dimernog oblika purinske nukleozidne fosforilaze iz bakterije Escherichia coli
Pristup korisnicima matične ustanove
diplomski rad
Modeliranje stabilnosti heksamernog i dimernog oblika purinske nukleozidne fosforilaze iz bakterije Escherichia coli
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2012. urn:nbn:hr:217:248784
Hajnić, Matea
Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Biološki odsjek

Institucijski repozitorij: Repozitorij Prirodoslovno-matematičkog fakulteta

Citirajte ovaj rad

Hajnić, M. (2012). Modeliranje stabilnosti heksamernog i dimernog oblika purinske nukleozidne fosforilaze iz bakterije Escherichia coli (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:248784

Hajnić, Matea. "Modeliranje stabilnosti heksamernog i dimernog oblika purinske nukleozidne fosforilaze iz bakterije Escherichia coli." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2012. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:248784

Hajnić, Matea. "Modeliranje stabilnosti heksamernog i dimernog oblika purinske nukleozidne fosforilaze iz bakterije Escherichia coli." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2012. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:248784

Hajnić, M. (2012). 'Modeliranje stabilnosti heksamernog i dimernog oblika purinske nukleozidne fosforilaze iz bakterije Escherichia coli', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 22.12.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:248784

Hajnić M. Modeliranje stabilnosti heksamernog i dimernog oblika purinske nukleozidne fosforilaze iz bakterije Escherichia coli [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2012 [pristupljeno 22.12.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:248784

M. Hajnić, "Modeliranje stabilnosti heksamernog i dimernog oblika purinske nukleozidne fosforilaze iz bakterije Escherichia coli", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2012. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:248784

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:248784
Podaci o radu
NaslovModeliranje stabilnosti heksamernog i dimernog oblika purinske nukleozidne fosforilaze iz bakterije Escherichia coli
Naslov (engleski)Stability of the dimeric and hexameric form of purine nucleoside phosphorylase from Escherichia coli - a computational study
AutorMatea Hajnić
MentorBranimir Bertoša (mentor)
Član povjerenstvaBranimir Bertoša (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaIta Gruić Sovulj (član povjerenstva)
Član povjerenstvaKristian Vlahoviček (član povjerenstva)
Član povjerenstvaMaja Matulić (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Biološki odsjek)
Zagreb
Datum i država obrane2012-09-24, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Biologija
Sažetak
Purinska nukleozidna fosforilaza (PNPaza) sudjeluje u pomodnom metaboličkom putu purina (od engl. “salvage pathway”) te omogućuje stanici da iskoristi komponente metaboličkog otpada za ponovnu sintezu nukleotida. Biološki aktivni oblik PNPaze u bakteriji Escherichia coli je homoheksamer koji se može opisati kao trimer dimera povezanih nekovalentnim interakcijama između kojih nije dokazana kooperativnost. Koristeći metode računalne biofizike istražena je mogućnost dobivanja stabilnih i funkcionalnih dimera uvođenjem mutacija u homoheksamernu strukturu divljeg tipa. Mutacije su uvedene s ciljem kidanja heksamerne strukture i stvaranja stabilnih dimera u otopini kako bi se provjerilo predstavlja li dimer osnovnu katalitičku jedinicu. Na temelju rezultata molekulske dinamike identificiran je mutant s kombinacijom mutacija koja bi mogla dovesti do raspada homoheksamerne strukture PNPaze u stabilne dimerne podjedinice.
Sažetak (engleski)
Purine nucleoside phosphorylase (PNP) is one of the key enzymes in purine salvage pathway which helps cells to recover nucleotides from degradation intermediates of nucleic acids. Biologically active form of PNP in Escherichia coli is a homohexamer, also seen as a trimer of dimers mutually connected with non-covalent bonds, and still with no cooperativity proven between them. In order to examine if a dimer is sufficient for catalysis, combinations of mutations were introduced in silico into hexameric structure of wild type PNP from E.coli. Mutations or combinations thereof were introduced to disrupt the homohexameric form and to obtain stable dimers in solution. Based on the results obtained from molecular dynamic simulations, a mutant with the most promising combination of mutations was identified. These specific mutations could potentially cause the breakdown of hexameric structure and result in the formation of stable dimers.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:217:248784
Studijski programNaziv: Molekularna biologija
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/magistra molekularne biologije (mag. biol. mol.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaPristup korisnicima matične ustanove
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2017-05-02 07:58:38