prikaz prve stranice dokumenta Clustering i klasifikacija proteinskih nizova
  Preuzmi
PDF 430.87 KB
diplomski rad
Clustering i klasifikacija proteinskih nizova
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2022. urn:nbn:hr:217:867979
Višek, Ivana
Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Matematički odsjek

Institucijski repozitorij: Repozitorij Prirodoslovno-matematičkog fakulteta

Citirajte ovaj rad

Višek, I. (2022). Clustering i klasifikacija proteinskih nizova (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:867979

Višek, Ivana. "Clustering i klasifikacija proteinskih nizova." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2022. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:867979

Višek, Ivana. "Clustering i klasifikacija proteinskih nizova." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2022. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:867979

Višek, I. (2022). 'Clustering i klasifikacija proteinskih nizova', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 23.12.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:867979

Višek I. Clustering i klasifikacija proteinskih nizova [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2022 [pristupljeno 23.12.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:867979

I. Višek, "Clustering i klasifikacija proteinskih nizova", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2022. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:867979

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:867979
Podaci o radu
NaslovClustering i klasifikacija proteinskih nizova
Naslov (engleski)Clustering and classification of protein sequences
AutorIvana Višek
MentorPavle Goldstein (mentor)
Član povjerenstvaPavle Goldstein (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaHrvoje Planinić (član povjerenstva)
Član povjerenstvaBojan Basrak (član povjerenstva)
Član povjerenstvaMea Bombardelli (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Matematički odsjek)
Zagreb
Datum i država obrane2022-07-20, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Matematika
Sažetak
Problematika ovog rada je nenadzirana klasifikacija niza motiva nekog proteina. Prelaskom u vektorski prostor želi se motive klasificirati ovisno o tome jesu li dovoljno slični upitu ili nisu. Razvijena metoda traži najgušću kuglu sa zadanim radijusom. Testiranje točnosti radijusa je provedeno nad podacima u kojima se zna je li motiv TP ili nije. Određeno je težište svih TP, ta točka je uzeta kao središte kugle zadanog radijusa te rezultati pokazuju da je radijus zaista optimalan. Zatim, prolaskom po svim točkama te traženjem najgušće kugle u podacima, dobije se kugla s neravnomjerno raspoređenim podacima unutar nje. Kako bi podaci bili ravnomjerno raspršeni oko središta, središte se pomakne na težište točaka koje se nalaze unutar kugle. Taj korak se ponavlja 5 puta te metoda staje pronalaskom težišta koje se sljedećom iteracijom ne pomiče.
Sažetak (engleski)
This thesis is concerned with unsupervised classification of protein motifs. Using standard methods, the problem is reduced to some geometrical considerations - searching for the optimal n-dimensional ball - in a certain Euclidean space. The radius of the n-ball has been derived previously, and we test that it is, indeed, the optimal solution. We develop a method for optimizing the center of the ball and test it on four standard plant proteomes, with very good results.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:217:867979
Studijski programNaziv: Matematička statistika
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/magistra matematike (mag. math.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaOtvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2022-09-16 09:00:50