prikaz prve stranice dokumenta Uloga proteina BPM1 u mehanizmu metilacije DNA de novo tijekom razvoja uročnjaka (Arabidopsis thaliana L.)
Rad dostupan nakon 2025-01-24
disertacija
Uloga proteina BPM1 u mehanizmu metilacije DNA de novo tijekom razvoja uročnjaka (Arabidopsis thaliana L.)
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2023. urn:nbn:hr:217:895020
Vuk, Tamara
Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Biološki odsjek

Institucijski repozitorij: Repozitorij Prirodoslovno-matematičkog fakulteta

Citirajte ovaj rad

Vuk, T. (2023). Uloga proteina BPM1 u mehanizmu metilacije DNA de novo tijekom razvoja uročnjaka (Arabidopsis thaliana L.) (Disertacija). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:895020

Vuk, Tamara. "Uloga proteina BPM1 u mehanizmu metilacije DNA de novo tijekom razvoja uročnjaka (Arabidopsis thaliana L.)." Disertacija, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2023. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:895020

Vuk, Tamara. "Uloga proteina BPM1 u mehanizmu metilacije DNA de novo tijekom razvoja uročnjaka (Arabidopsis thaliana L.)." Disertacija, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2023. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:895020

Vuk, T. (2023). 'Uloga proteina BPM1 u mehanizmu metilacije DNA de novo tijekom razvoja uročnjaka (Arabidopsis thaliana L.)', Disertacija, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 25.11.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:895020

Vuk T. Uloga proteina BPM1 u mehanizmu metilacije DNA de novo tijekom razvoja uročnjaka (Arabidopsis thaliana L.) [Disertacija]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2023 [pristupljeno 25.11.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:895020

T. Vuk, "Uloga proteina BPM1 u mehanizmu metilacije DNA de novo tijekom razvoja uročnjaka (Arabidopsis thaliana L.)", Disertacija, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2023. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:895020

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:895020
Podaci o radu
NaslovUloga proteina BPM1 u mehanizmu metilacije DNA de novo tijekom razvoja uročnjaka (Arabidopsis thaliana L.)
Naslov (engleski)The role of BPM1 protein in de novo DNA methylation mechanism during development of Arabidopsis thaliana L.
AutorTamara Vuk
MentorDunja Leljak-Levanić (mentor)
Član povjerenstvaMirjana Pavlica (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaBiljana Balen (član povjerenstva)
Član povjerenstvaSnježana Mihaljević (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Biološki odsjek)
Zagreb
Datum i država obrane2023-01-24, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Biologija
Univerzalna decimalna klasifikacija
(UDC)		577 - Biokemija. Molekularna biologija. Biofizika
Sažetak
Proteini BPM iz vrste Arabidopsis thaliana primarnu ulogu ostvaruju u putu proteasomalne razgradnje ovisne o ubikvitinu, u sklopu kojeg prepoznaju specifične supstrate za razgradnju. Prethodno je utvrđena interakcija proteina BPM1 s proteinima RDM1 i DMS3, komponentama metilacijskog mehanizma RdDM. Uloga proteina BPM1 u mehanizmu RdDM u ovom je radu ispitana primjenom kromatinske imunoprecipitacije u svrhu identifikacije novih ciljnih gena ovog mehanizma u čijoj regulaciji metilacije posreduje protein BPM1. Identificirani su geni FBW2, RKP i AGL14, a kao referentni odabran je gen CML41. Analizom metilacije ovih gena metodom bisulfitnog sekvenciranja i pirosekvenciranja u linijama s prekomjernom ekspresijom proteina od interesa (oeBPM1, oeDMS3), te linijama s narušenom funkcijom mehanizma RdDM (dms3-1, nrpe1-10), potvrđen je stimulativni učinak proteina BPM1 na aktivnost mehanizma, koji je najizraženiji tijekom embriogeneze, a sam mehanizam RdDM značajniji je za zigotnu nego za somatsku embrigenezu. Ovisno o poziciji, učinci metilacijskih događaja reflektiraju se na ekspresiju svih analiziranih gena.
Sažetak (engleski)
Proteins BPM of Arabidopsis thaliana have a primary role in the ubiquitin-dependent proteasomal degradation pathway, where they recognize specific substrates for degradation. The interaction of BPM1 protein with RDM1 and DMS3, components of RdDM methylation mechanism, has previously been established. Here, the role of BPM1 protein in RdDM was analyzed using chromatin immunoprecipitation for identification of new RdDM targets whose methylation is mediated by BPM1 protein. Genes FBW2, RKP and AGL14 were identified as targets, and CML41 was chosen as a reference gene. Methylation analysis of these genes was conducted using bisulfite sequencing and pyrosequencing in lines with overexpression of BPM1 (oeBPM1) or DMS3 (oeDMS3), and lines with impaired RdDM function (dms3-1, nrpe1-10). The results confirmed a stimulative role of BPM1 protein in RdDM. This mechanism proved to be more significant in zygotic than somatic embyrogenesis. Depending on the position, methylation had a diverse effect on expression of analyzed genes.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:217:895020
Datum promocije2023
Studijski programNaziv: Biologija
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: poslijediplomski doktorski
Akademski / stručni naziv: doktor/doktorica znanosti, područje prirodnih znanosti, polje biologija (dr.sc.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaRad dostupan nakon
Datum isteka embarga: 2025-01-24
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2023-01-31 12:20:09