prikaz prve stranice dokumenta Odabir i evaluacija kandidatnih referentnih gena za analizu genske ekspresije u mozgu gušterica roda Podarcis
Rad dostupan nakon 2025-09-27
diplomski rad
Odabir i evaluacija kandidatnih referentnih gena za analizu genske ekspresije u mozgu gušterica roda Podarcis
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2023. urn:nbn:hr:217:419515
Petrović, Ana-Marija
Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Biološki odsjek

Institucijski repozitorij: Repozitorij Prirodoslovno-matematičkog fakulteta

Citirajte ovaj rad

Petrović, A. M. (2023). Odabir i evaluacija kandidatnih referentnih gena za analizu genske ekspresije u mozgu gušterica roda Podarcis (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:419515

Petrović, Ana Marija. "Odabir i evaluacija kandidatnih referentnih gena za analizu genske ekspresije u mozgu gušterica roda Podarcis." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2023. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:419515

Petrović, Ana Marija. "Odabir i evaluacija kandidatnih referentnih gena za analizu genske ekspresije u mozgu gušterica roda Podarcis." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2023. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:419515

Petrović, A. M. (2023). 'Odabir i evaluacija kandidatnih referentnih gena za analizu genske ekspresije u mozgu gušterica roda Podarcis', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 01.05.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:419515

Petrović AM. Odabir i evaluacija kandidatnih referentnih gena za analizu genske ekspresije u mozgu gušterica roda Podarcis [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2023 [pristupljeno 01.05.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:419515

A. M. Petrović, "Odabir i evaluacija kandidatnih referentnih gena za analizu genske ekspresije u mozgu gušterica roda Podarcis", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2023. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:419515

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:419515
Podaci o radu
NaslovOdabir i evaluacija kandidatnih referentnih gena za analizu genske ekspresije u mozgu gušterica roda Podarcis
Naslov (engleski)Selection and evaluation of candidate reference genes for gene expression analysis in the brain of Podarcis lizards
AutorAna-Marija Petrović
MentorSofia Ana Blažević (mentor)
Član povjerenstvaSofia Ana Blažević (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaMaja Matulić (član povjerenstva)
Član povjerenstvaInga Urlić (član povjerenstva)
Član povjerenstvaMartina Šeruga Musić (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Biološki odsjek)
Zagreb
Datum i država obrane2023-09-27, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Biologija
Sažetak
Agresivnost je oblik kompetitivnog ponašanja koji snažno utječe na odnose između jedinki i vrsta. Izraženo agresivno ponašanje je primijećeno u odnosima jedinki vrsta Podarcis sicula (primorska gušterica) i Podarcis melisellensis (krška gušterica) na otocima i kontinentalnim dijelovima jadranske obale, gdje agresivnija P. sicula potiskuje P. melisellensis i smanjuje njen areal. Poznata je uloga monoamina u inicijaciji agresivnog ponašanja, naročito dopamina, serotonina i noradrenalina. Razlike u njihovim koncentracijama su u osnovi brojnih ponašanja i odraz su diferencijalne ekspresije njihovih metaboličkih gena. Profiliranje ekspresije gena pomoću RT-qPCR je robusna tehnika koja se sve češće koristi u neuroetološkim istraživanjima. Preduvjet za RT-qPCR analize je određivanje i provjera optimalnih referentnih gena koji će služiti za normalizaciju dobivenih rezultata. Cilj ovog diplomskog rada je analizirati stabilnost ekspresije deset potencijalnih referentnih gena (ACTB, GAPDH, GUSB, HMBS, HPRT1, PGK1, SDHA, TBP, TFRC i YWHA) i odabrati pet za buduće analize genske ekspresije, kao i optimizirati temperature taljenja odabranih parova početnica i učinkovitost umnažanja ciljanih sekvenci. Kao najstabilniji referentni geni su se pokazali: PGK1, YWHAZ, HMBS, HPRT1 i GUSB.
Sažetak (engleski)
Aggression is a form of competitive behavior that strongly affects relationships between individuals and species. Pronounced aggressive behavior was observed in the relationship between the species Podarcis sicula (coastal lizard) i Podarcis melisellensis (karst lizard) on the islands and continental parts of the Adriatic coast, where the more aggressive P. sicula suppresses P. melisellensis and reduces its areal. The role of monoamines in the initiation of aggressive behavior is already known; dopamine, serotonin and noradrenaline in particular. The difference in their amounts is the basis of numerous types of behaviors and is a reflection of the differential expression of their metabolic genes. Gene expression profiling using RT-qPCR is a robust technique that is increasingly being used in neuroethological research. A prerequisite for RT-qPCR analysis is the determination and validation of optimal reference genes that will serve to normalize the obtained data. The aim of this thesis is to analyze the expression stability of ten potential reference genes (ACTB, GAPDH, GUSB, HMBS, HPRT1, PGK1, SDHA, TBP, TFRC and YWHA) and to select five for future gene expression analysis, as well as to optimize the melting temperatures of the selected primer pairs and amplification efficiencies of target sequences. The most stably expressed reference genes were determined to be: PGK1, YWHAZ, HMBS, HPRT1 and GUSB.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:217:419515
ProjektŠifra: UIP-2019-04-8469
Naziv: Dopaminska regulacija kompetitivnog ponašanja u kohabituirajućim populacijama guštera Podarcis siculus i Podarcis melisellensis
Naziv: Dopamine regulation of competitive behavior in coexisting populations of lizards Podarcis siculus and Podarcis melisellensis
Kratica: BOLDer
Voditelj: Sofia Ana Blažević
Pravna nadležnost: Hrvatska
Financijer: HRZZ
Linija financiranja: UIP
Studijski programNaziv: Molekularna biologija
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/magistra molekularne biologije (mag. biol. mol.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaRad dostupan nakon
Datum isteka embarga: 2025-09-27
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2023-10-17 11:17:57