prikaz prve stranice dokumenta Termodinamička i strukturna karakterizacija kompleksa ciklopeptida s kolorimetrijskim i fluorescentnim anionskim bojama
Rad dostupan nakon 2026-02-16
diplomski rad
Termodinamička i strukturna karakterizacija kompleksa ciklopeptida s kolorimetrijskim i fluorescentnim anionskim bojama
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2024. urn:nbn:hr:217:576107
Otmačić, Lucija
Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Kemijski odsjek

Institucijski repozitorij: Repozitorij Prirodoslovno-matematičkog fakulteta

Citirajte ovaj rad

Otmačić, L. (2024). Termodinamička i strukturna karakterizacija kompleksa ciklopeptida s kolorimetrijskim i fluorescentnim anionskim bojama (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:576107

Otmačić, Lucija. "Termodinamička i strukturna karakterizacija kompleksa ciklopeptida s kolorimetrijskim i fluorescentnim anionskim bojama." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2024. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:576107

Otmačić, Lucija. "Termodinamička i strukturna karakterizacija kompleksa ciklopeptida s kolorimetrijskim i fluorescentnim anionskim bojama." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2024. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:576107

Otmačić, L. (2024). 'Termodinamička i strukturna karakterizacija kompleksa ciklopeptida s kolorimetrijskim i fluorescentnim anionskim bojama', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 24.11.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:576107

Otmačić L. Termodinamička i strukturna karakterizacija kompleksa ciklopeptida s kolorimetrijskim i fluorescentnim anionskim bojama [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2024 [pristupljeno 24.11.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:576107

L. Otmačić, "Termodinamička i strukturna karakterizacija kompleksa ciklopeptida s kolorimetrijskim i fluorescentnim anionskim bojama", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2024. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:576107

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:576107
Podaci o radu
NaslovTermodinamička i strukturna karakterizacija kompleksa ciklopeptida s kolorimetrijskim i fluorescentnim anionskim bojama
Naslov (engleski)Thermodynamic and structural characterization of cyclopeptide complexes with colorimetric and fluorescent anionic dyes
AutorLucija Otmačić
MentorGordan Horvat (mentor)
Član povjerenstvaGordan Horvat (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaIva Juranović Cindrić (član povjerenstva)
Član povjerenstvaAleksandra Maršavelski (član povjerenstva)
Član povjerenstvaVladislav Tomišić (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Kemijski odsjek)
Zagreb
Datum i država obrane2024-02-16, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Kemija
Sažetak
U ovom su radu ispitana spektroskopska i strukturna svojstva te termodinamička stabilnost kompleksa homociklopentapeptida s kolorimetrijskim i fluorescentnim anionskim bojama u acetonitrilu pomoću spektrofluorimetrijskih i spektrofotometrijskih titracija i simulacija molekulske dinamike. Kao ciklopeptidi korišteni su ciklopentafenilalanin, ciklopentaleucin i derivat ciklopentalizina čije su amino skupine na bočnim ograncima zaštićene BOC skupinama. Kao reprezentativni anioni sulfonatnih fluorescentnih boja korišteni su 8-anilino-1-naftalensulfonska kiselina i alizarin crveno S, a kao reprezentativni anion sulfonatnih kolorimetrijskih boja korišten je metiloranž. Kao reprezentativni anioni karboksilatnih fluorescentnih boja korištene su N-acetilirane aromatske amino kiseline triptofan i fenilalanin. Rezultati upućuju na stvaranje stabilnih kompleksa između ciklopepentaleucina i derivata ciklopentalizina sa sulfonatnim i karboksilatnim fluorescentnim i kolorimetrijskim bojama, dok je u slučaju ciklopentafenilalanina afinitet prema fluorescentnim karboksilatnim bojama nešto viši. Kod nastalih kompleksa ciklopeptida s fluorescentnim sulfonatnim i karboksilatnim bojama u većini slučajeva opažena je značajna razlika u molarnim spektrima kompleksa, dok ta razlika nije uočena kod kompleksa s kolorimetrijskom sulfonatnom bojom. Također, rezultati provedenih MD simulacija u otapalu upućuju na koordinaciju aniona preko amidnih protona ciklopeptida.
Sažetak (engleski)
In this work, spectroscopic and structural properties, as well as thermodynamic stability of homocyclopentapeptide complexes with colorimetric and fluorescent anionic dyes in acetonitrile were examined by means of spectrofluorimetric and spectrophotometric titrations and molecular dynamics simulations. As cyclopeptides, cyclopentaphenylalanine, cyclopentaleucine and cyclopentalysine derivative with BOC protected amino group side chains were used. 8-anilino-1-naftalenesulfonic acid and alizarin red S were used as sulfonic fluorescent dyes representatives, while methyl orange was used as sulfonic colorimetric dye representative. N-acetylated aromatic amino acids tryptophan and phenylalanine were used as carboxylic fluorescent dyes representatives. The results indicate that both of cyclic peptides form stabile complexes with fluorescent and colorimetric sulfonic and carboxylic dyes, while the affinity of cyclopentaphenylalanine towards fluorescent carboxylic dyes is somewhat higher. In most cases a significant difference in molar spectra of fluorescent dye complexes with both peptides were observed. That significant difference was not observed with colorimetric anion dye complexes. Also, the results obtained by MD simulations indicate that the anions are coordinated by the amide protons of the peptide.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:217:576107
ProjektŠifra: IP-2019-04-9560
Naziv: Koordinacijske reakcije makrocikličkih liganada u otopini
Naziv: Coordination Reactions of Macrocyclic Ligands in Solution
Kratica: MacroSol
Voditelj: Vladislav Tomišić
Pravna nadležnost: Hrvatska
Financijer: HRZZ
Linija financiranja: IP
Studijski programNaziv: Kemija; smjerovi: Istraživački
Smjer: Istraživački
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: sveučilišni/a magistar/magistra kemije (univ. mag. chem.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaRad dostupan nakon
Datum isteka embarga: 2026-02-16
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2024-03-12 12:24:16