prikaz prve stranice dokumenta Adaptivna laboratorijska evolucija bakterije Geobacillus thermoglucosidasius u uvjetima ekstremnog okoliša
Rad dostupan nakon 2025-09-02
diplomski rad
Adaptivna laboratorijska evolucija bakterije Geobacillus thermoglucosidasius u uvjetima ekstremnog okoliša
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2024. urn:nbn:hr:217:147622
Saraga, Ivana
Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Biološki odsjek

Institucijski repozitorij: Repozitorij Prirodoslovno-matematičkog fakulteta

Citirajte ovaj rad

Saraga, I. (2024). Adaptivna laboratorijska evolucija bakterije Geobacillus thermoglucosidasius u uvjetima ekstremnog okoliša (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:147622

Saraga, Ivana. "Adaptivna laboratorijska evolucija bakterije Geobacillus thermoglucosidasius u uvjetima ekstremnog okoliša." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2024. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:147622

Saraga, Ivana. "Adaptivna laboratorijska evolucija bakterije Geobacillus thermoglucosidasius u uvjetima ekstremnog okoliša." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2024. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:147622

Saraga, I. (2024). 'Adaptivna laboratorijska evolucija bakterije Geobacillus thermoglucosidasius u uvjetima ekstremnog okoliša', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 25.11.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:147622

Saraga I. Adaptivna laboratorijska evolucija bakterije Geobacillus thermoglucosidasius u uvjetima ekstremnog okoliša [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2024 [pristupljeno 25.11.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:147622

I. Saraga, "Adaptivna laboratorijska evolucija bakterije Geobacillus thermoglucosidasius u uvjetima ekstremnog okoliša", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2024. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:147622

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:147622
Podaci o radu
NaslovAdaptivna laboratorijska evolucija bakterije Geobacillus thermoglucosidasius u uvjetima ekstremnog okoliša
Naslov (engleski)Adaptive laboratory evolution of bacterium Geobacillus thermoglucosidasius in extreme enironmental conditions
AutorIvana Saraga
MentorIvan Mijaković (mentor)
MentorDamjan Franjević (komentor)
Član povjerenstvaDamjan Franjević (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaTomislav Ivanković (član povjerenstva)
Član povjerenstvaGoran Klobučar (član povjerenstva)
Član povjerenstvaJosip Skejo (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Biološki odsjek)
Zagreb
Datum i država obrane2024-09-02, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Biologija
Sažetak
Kako bi se smanjila koncentracija CO2 u zraku, znanstvenici pokušavaju koristiti bakterije kao stanične tvornice koje bi hvatale dodatni CO2 te pomoću procesa mineralizacije ga “reciklirale” i kasnije koristili u različitim granama industrije. Ovaj rad se bazira na adaptivnoj laboratorijskoj evoluciji tri soja bakterije Geobacillus thermoglucosidasius. Ova termofilna i gram-pozitivna bakterija može rasti pri maksimalnoj vrijednosti pH od 8.5 te temperaturi od 70°C. U ovom je istraživanju provedena adaptivna laboratorijska evolucija na okoliš gdje prevladava alkalni pH (>8.5) te temperatura viša od 70°C: uvjeti koji odgovaraju ugljičnoj anhidrazi. To je esencijalno jer je jednom od korištenih sojeva pomoću genetske modifikacije ugljična anhidraza, enzim koji hvata ugljik, pričvršćena za staničnu stijenku. Također, jedan je od ciljeva bio i usporediti efikasnost protokola rađenog ručno s automatiziranim protokolom. Rezultati su pokazali 4 zajedničke mutacije na genima šest replika dobivenih ručno rađenim protokolom zbog adaptacije na pH 9.1. Replike dobivene automatiziranim protokolom su imale 4 zajedničke mutacije na jednoj skupini sojeva i 1 na drugoj. Dostignuti pH je 9.01. Adaptivna laboratorijska evolucija se još jednom dokazala korisnom za optimizaciju staničnih tvornica za industrijsku upotrebu te se ručno rađeni protokol dokazao efikasnijim od automatiziranog.
Sažetak (engleski)
To fight high CO2 emissions scientists are trying to use bacteria as cell factories to capture extra CO2 via mineralisation to “recycle” it and use it in different industries. This study aimed to use adaptive laboratory evolution on three strains of Geobacillus thermoglucosidasius. This thermophilic and gram-positive bacterium can grow at a maximum of 8.5 pH and 70°C temperature. One of the strains was genetically modified to express a carbonic anhydrase, the enzyme that enables carbon capture, anchored to its cell wall. The goal was to adapt these strains to an environment that is defined by alkaline pH (> 8.5) and temperature higher than 70°C: the conditions that favour carbonic anhydrase activity. We also wanted to compare the efficiency of a manually performed protocol versus automation. The results demonstrated 4 common mutations among 6 manually executed replicates that managed to adapt to 9.1 pH. Automatically performed replicates reached a maximum pH of 9.01 and had 4 common mutations for one set of replicates and 1 common mutation for the second set. Overall, adaptive laboratory evolution once more proved useful for optimizing cell factories for industrial applications and the manual protocol performed better than the automatic one.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikengleski
URN:NBNurn:nbn:hr:217:147622
Studijski programNaziv: Eksperimentalna biologija
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: sveučilišni/a magistar/magistra eksperimentalne biologije (univ. mag. biol. exp.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaRad dostupan nakon
Datum isteka embarga: 2025-09-02
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2024-09-16 15:52:33