prikaz prve stranice dokumenta Uloga transpozona u nastanku introna
  Preuzmi
PDF 1014.28 KB
završni rad
Uloga transpozona u nastanku introna
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2017. urn:nbn:hr:217:148264
Pali, Dorotea
Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Biološki odsjek

Institucijski repozitorij: Repozitorij Prirodoslovno-matematičkog fakulteta

Citirajte ovaj rad

Pali, D. (2017). Uloga transpozona u nastanku introna (Završni rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:148264

Pali, Dorotea. "Uloga transpozona u nastanku introna." Završni rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2017. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:148264

Pali, Dorotea. "Uloga transpozona u nastanku introna." Završni rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2017. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:148264

Pali, D. (2017). 'Uloga transpozona u nastanku introna', Završni rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 03.01.2025., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:148264

Pali D. Uloga transpozona u nastanku introna [Završni rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2017 [pristupljeno 03.01.2025.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:148264

D. Pali, "Uloga transpozona u nastanku introna", Završni rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2017. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:148264

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:148264
Podaci o radu
NaslovUloga transpozona u nastanku introna
Naslov (engleski)Mechanism for DNA transposons to generate introns
AutorDorotea Pali
MentorIvana Ivančić Baće (mentor)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Biološki odsjek)
Zagreb
Datum i država obrane2017-09-06, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Biologija
Sažetak
Otkriće introna, a kasnije i njihove funkcije u genomu, značilo je početak boljeg razumijevanja prirode eng. „junk DNA“ te regulacije genske ekspresije kod eukariota. Samo podrijetlo introna zasad je slabo istraženo. Najnoviji model prijenosa uz pomoć transpozonskih elemenata nudi obećavajući mehanizam za neke od introna nastalih u novije vrijeme. Intronski elementi (eng. Introner Element, IE) kod M. pusille i A. anophagefferens pronađeni su u velikom broju, te ne pokazuju međusobnu sličnost u sekvencama. Mehanizam njihove ugradnje, koji uključuje formiranje jednog mjesta izrezivanja unutar invertnog rubnog ponavljanja (eng. Terminal Inverted Repeat, TIR) u intronu, te drugog mjesta izrezivanja unutar dupliciranog ciljnog mjesta (eng. Target Site Duplication, TSD) u eksonu, osigurava pravilno izrezivanje intronskog elementa bez narušavanja struktura i funkcija proteina kodiranih susjednim eksonima. Sličnost s DNA transpozonima vidljiva je u formiranju TSD-a dugih 3 pb kod M. pusille i 8 pb kod A. anophagefferens, budući da DNA transpozoni prilikom svoje ugradnje stvaraju direktna ponavljanja i cik-cak ureze. Zbog toga što su kratki i ne sadržavaju okvire čitanja za kodiranje transpozaze, pripadaju skupini neautonomnih DNA transpozona. S obzirom na relativnu jednostavnost mehanizma te sveprisutnost DNA transpozona kod eukariota, postoji mogućnost da ovaj način nastanka introna nije rezerviran samo za nedavne događaje, već se odvijao i prije u evoluciji. Međutim, mali broj otkrivenih introna ovog tipa navodi nas na zaključak kako je vjerojatno prije riječ o iznimci nego pravilu, te da ovaj mehanizam najvjerojatnije ne može opisati nastanak većine introna. Valja istražiti prisutnost i učestalost ovog mehanizma u ostalim organizmima, te pronaći alternativne načine ugradnje introna.
Sažetak (engleski)
The discovery of introns and their function in a genome was of great importance for better understanding the nature of junk DNA and their role in regulation of gene expression in eukaryotes. Their origin, however, is not well understood. A new model, that explains their motion through transsmition of transposable elements, is believed to explain recent intron gain. Introner Elements (IEs) of M. pusilla and A. anophagefferens were found in a great number of copies and show lack of sequence similarity. The proposed mechanism is based on the discovery that every IE caries one splice site at the end of Terminal Inverted Repeat (TIR) and another splice site at Target Site Duplication (TSD) sequence. The introns are removed perfectly, without altering protein structure and function. The elements being inserted that generate 3 bp long TSDs in M. pusilla and 8 bp long TSDs in A. anophagefferens are similar to DNA transposons, which are known to form direct repeats while inserting into DNA. IEs are small and non-autonomous DNA transposons that contain no open reading frames, making them reliable upon transposases encoded elsewhere in genome. Due to simplicity of this mechanism and ubiquity of DNA transposons, it is important to explore the possibility of that kind of intron gain happening earlier in evolution. Considering that a small number of those introns has been found, this mechanism probably isn't the main source of their generation. It is essential to determine their frequency in other organisms, or some alternative mechanisms for their insertion.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:217:148264
Studijski programNaziv: Molekularna biologija
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: preddiplomski
Akademski / stručni naziv: sveučilišni/a prvostupnik/prvostupnica (baccalaureus/baccalaurea) molekularne biologije (univ. bacc. biol. mol.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaOtvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2017-09-18 12:53:35