prikaz prve stranice dokumenta Strukturna i funkcijska analiza veznog mjesta kvaščevog proteina Sec13
  Preuzmi
PDF 7.84 MB
diplomski rad
Strukturna i funkcijska analiza veznog mjesta kvaščevog proteina Sec13
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2009. urn:nbn:hr:217:907353
Gogala, Marko
Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Biološki odsjek

Institucijski repozitorij: Repozitorij Prirodoslovno-matematičkog fakulteta

Citirajte ovaj rad

Gogala, M. (2009). Strukturna i funkcijska analiza veznog mjesta kvaščevog proteina Sec13 (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:907353

Gogala, Marko. "Strukturna i funkcijska analiza veznog mjesta kvaščevog proteina Sec13." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2009. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:907353

Gogala, Marko. "Strukturna i funkcijska analiza veznog mjesta kvaščevog proteina Sec13." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2009. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:907353

Gogala, M. (2009). 'Strukturna i funkcijska analiza veznog mjesta kvaščevog proteina Sec13', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 23.12.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:907353

Gogala M. Strukturna i funkcijska analiza veznog mjesta kvaščevog proteina Sec13 [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2009 [pristupljeno 23.12.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:907353

M. Gogala, "Strukturna i funkcijska analiza veznog mjesta kvaščevog proteina Sec13", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2009. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:907353

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:907353
Podaci o radu
NaslovStrukturna i funkcijska analiza veznog mjesta kvaščevog proteina Sec13
Naslov (engleski)Structural and functional analysis of the yeast protein Sec13 with an qmphasis on its protein interaction interface
AutorMarko Gogala
MentorThomas Schwartz (mentor)
Član povjerenstvaIvana Weygand-Đurašević (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaDunja Leljak-Levanić (član povjerenstva)
Član povjerenstvaDijana Škorić (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Biološki odsjek)
Zagreb
Datum i država obrane2009, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Biologija
Sažetak
Jezgra omeđena ovojnicom temeljna je osobina eukariota. Kako je kompleks jezgrine pore (NPC) jedini posrednik u transportu između jezgre i citoplazme, rasvjetljavanje njegove strukture važno je za razumijevanje eukariotskih stanica. Sec13 je komponenta NPC čija je uloga u održavanju i stabilizaciji kompleksa nejasna. Njegova dvojna uloga u vezanju proteina Nup145C u sklopu NPC te proteina Sec31 u sklopu vezikula tipa COPII otežava mutacijsku analizu. Cilj ovog projekta bio je riješiti strukturu Sec13 u kompleksu sa insercijskom regijom Nup145C, kako bi se dobila jasna slika veznog mjesta Sec13/Nup145C. Riješena struktura uspoređena je sa strukturama kompleksa Sec13/Sec31. Na temelju razlika među veznim mjestima osmišljen je mutirani Sec13 koji veže isključivo protein Sec31. Posljedica ove mutacije potvrđena je pokusima in vitro.
Sažetak (engleski)
Possession of an envelope-coated nucleus is the defining trait of eukaryotes. Since the nuclear pore complex (NPC) is the only known mediator of nucleo-cytoplasmic traffic, elucidating its structure is important for understanding eukaryotic cells. Sec13 is a component of the NPC whose importance for the stability of the complex is unclear. Its dual role in binding proteins Nup145 in the NPC and Sec31 in COPII vesicles makes mutational analysis of Sec13 function difficult. The goal of this project was solving a structure of Sec13 in complex with the Nup145C insertion blade that would provide a clear view of the Sec13/Nup145C interface. The obtained structure was compared to the structures of the Sec13/Sec31 complex. Based on the differences between the interaction sites of the structures, a mutant Sec13 protein was designed, that binds specifically to Sec31, but has lost affinity for Nup145C. The effect of this mutation was confirmed by in vitro experiments.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:217:907353
Studijski programNaziv: Molekularna biologija
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: diplomski
Akademski / stručni naziv: magistar/magistra molekularne biologije (mag. biol. mol.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaOtvoreni pristup
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2018-03-08 11:17:42