Određivanje količine proteina Cas3 u ovisnosti o jačini promotora, temperaturi i šaperonu HtpG u bakteriji Escherichia coli

Barbarić, Lea

prikaz prve stranice dokumenta Određivanje količine proteina Cas3 u ovisnosti o jačini promotora, temperaturi i šaperonu HtpG u bakteriji Escherichia coli

diplomski rad

Određivanje količine proteina Cas3 u ovisnosti o jačini promotora, temperaturi i šaperonu HtpG u bakteriji Escherichia coli

Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2021. urn:nbn:hr:217:291835

Barbarić, Lea

Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Kemijski odsjek

Institucijski repozitorij: Repozitorij Prirodoslovno-matematičkog fakulteta

Citirajte ovaj rad

APA 6th Edition

Barbarić, L. (2021). Određivanje količine proteina Cas3 u ovisnosti o jačini promotora, temperaturi i šaperonu HtpG u bakteriji Escherichia coli (Diplomski rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:291835

MLA 8th Edition

Barbarić, Lea. "Određivanje količine proteina Cas3 u ovisnosti o jačini promotora, temperaturi i šaperonu HtpG u bakteriji Escherichia coli." Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2021. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:291835

Chicago 17th Edition

Harvard

Barbarić, L. (2021). 'Određivanje količine proteina Cas3 u ovisnosti o jačini promotora, temperaturi i šaperonu HtpG u bakteriji Escherichia coli', Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 22.11.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:291835

Vancouver

Barbarić L. Određivanje količine proteina Cas3 u ovisnosti o jačini promotora, temperaturi i šaperonu HtpG u bakteriji Escherichia coli [Diplomski rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2021 [pristupljeno 22.11.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:291835

IEEE

L. Barbarić, "Određivanje količine proteina Cas3 u ovisnosti o jačini promotora, temperaturi i šaperonu HtpG u bakteriji Escherichia coli", Diplomski rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2021. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:291835

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:291835

Podaci o radu

Naslov	Određivanje količine proteina Cas3 u ovisnosti o jačini promotora, temperaturi i šaperonu HtpG u bakteriji Escherichia coli
Naslov (engleski)	Determination of the amount of Cas3 protein depending on the strenght of the promoter, temperature and chaperone HtpG in Escherichia coli
Autor	Lea Barbarić
Mentor	Ivana Ivančić Baće (mentor)
Član povjerenstva	Marko Močibob (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstva	Ivana Ivančić Baće (član povjerenstva)
Član povjerenstva	Đani Škalamera (član povjerenstva)
Član povjerenstva	Branimir Bertoša (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj	Sveučilište u Zagrebu Prirodoslovno-matematički fakultet (Kemijski odsjek) Zagreb
Datum i država obrane	2021-07-15, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana	PRIRODNE ZNANOSTI Kemija
Sažetak	Zbog učestalih napada bakteriofaga, veliki udio bakterija razvilo je specifičan obrambeni sustav adaptivne imunosti koji se naziva CRISPR-Cas. Sustav se sastoji od seta gena cas i lokusa CRISPR koji se sastoji od kratkih ponavljajućih sljedova između kojih se ugrađuju razmaknice koje potječu od strane DNA. U bakteriji Escherichia coli efikasnost zaštite bakterija od faga sustavom CRISPR-Cas ovisi o aktivnosti proteina Cas3 koja pak ovisi o temperaturi inkubacije i šaperonu HtpG. U ovom radu istraženo je utječe li šaperon HtpG na količinu proteina Cas3 u ovisnosti o temperaturi i jačini promotora. Uz to, istraženo je da li promjene u konformaciji šaperona HtpG utječu na aktivnost proteina Cas3, odnosno na efikasnost zaštite od infekcije. Rezultati sugeriraju da šaperon HtpG utječe na funkcionalne količine proteina Cas3 u ovisnosti o temperaturi, dok točkaste mutacije u proteinu HtpG nemaju utjecaja na interakciju HtpG s proteinom Cas3. Jačina promotora za gen cas3 je ključna i analiza količina proteina Cas3 je moguća samo nakon ekspresije s inducibilnog promotora.
Sažetak (engleski)	Due to frequent bacteriophage attacks, a large group of bacteria have developed a specific adaptive immunity defense system called CRISPR-Cas. The system consists of a set of cas genes and CRISPR locus consisting of short repeats between which spacers derived from foreign DNA are inserted. In Escherichia coli, the effectiveness of immunity against phages depends on the activity of Cas3, which depends on the incubation temperature and HtpG chaperone. In this work, the influence of HtpG chaperone on the amount of Cas3 protein as a function of temperature and promoter strength was investigated. In addition, it was investigated whether conformational changes of HtpG affect the activity of Cas3, ie the effectiveness of the immunity against infections. The results suggest that chaperone HtpG affects functional amounts of Cas3 protein as a function of temperature, whereas point mutations in HtpG protein have no effect on the interaction of HtpG with Cas3. The strength of the promoter for the cas3 gene is critical and analysis of the amount of Cas3 is only possible from an inducible promoter.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezik	hrvatski
URN:NBN	urn:nbn:hr:217:291835
Projekt	Šifra: IP-2016-06-8861 Naziv: Cas3 kao kontrolna točka obrane CRISPR-Cas: razjašnjenje njegove regulacije istraživanjem stabilnosti proteina i prepisivanja u bakteriji Escherichia coli Naziv: Cas3 as a key checkpoint for CRISPR-Cas immunity: Elucidating its regulation via protein stability and transcriptional control in Escherichia coli Kratica: Cas3 status Voditelj: Ivana Ivančić Baće Pravna nadležnost: Hrvatska Financijer: HRZZ Linija financiranja: IP
Studijski program	Naziv: Kemija; smjerovi: istraživački Smjer: istraživački Vrsta studija: sveučilišni Stupanj studija: diplomski Akademski / stručni naziv: magistar/magistra kemije (mag. chem.)
Vrsta resursa	Tekst
Način izrade datoteke	Izvorno digitalna
Prava pristupa	Otvoreni pristup Datum isteka embarga: 2022-07-15
Uvjeti korištenja
Datum i vrijeme pohrane	2021-09-02 12:18:34

Search form