prikaz prve stranice dokumenta Molekularna identifikacija bakterija roda Vibrio iz uzgajališta školjkaša u istočnom Jadranu
  Preuzmi
PDF 1.36 MB
završni rad
Molekularna identifikacija bakterija roda Vibrio iz uzgajališta školjkaša u istočnom Jadranu
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2021. urn:nbn:hr:217:821214
Buha, Tonka
Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
Biološki odsjek

Institucijski repozitorij: Repozitorij Prirodoslovno-matematičkog fakulteta

Citirajte ovaj rad

Buha, T. (2021). Molekularna identifikacija bakterija roda Vibrio iz uzgajališta školjkaša u istočnom Jadranu (Završni rad). Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet. Preuzeto s https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:821214

Buha, Tonka. "Molekularna identifikacija bakterija roda Vibrio iz uzgajališta školjkaša u istočnom Jadranu." Završni rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2021. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:821214

Buha, Tonka. "Molekularna identifikacija bakterija roda Vibrio iz uzgajališta školjkaša u istočnom Jadranu." Završni rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, 2021. https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:821214

Buha, T. (2021). 'Molekularna identifikacija bakterija roda Vibrio iz uzgajališta školjkaša u istočnom Jadranu', Završni rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, citirano: 22.11.2024., https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:821214

Buha T. Molekularna identifikacija bakterija roda Vibrio iz uzgajališta školjkaša u istočnom Jadranu [Završni rad]. Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet; 2021 [pristupljeno 22.11.2024.] Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:821214

T. Buha, "Molekularna identifikacija bakterija roda Vibrio iz uzgajališta školjkaša u istočnom Jadranu", Završni rad, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb, 2021. Dostupno na: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:821214

Za citiranje koristite ovu mrežnu adresu: https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:217:821214
Podaci o radu
NaslovMolekularna identifikacija bakterija roda Vibrio iz uzgajališta školjkaša u istočnom Jadranu
Naslov (engleski)Molecular identification of Vibrio genus bacteria from bivalve aquaculture sites in Eastern Adriatic
AutorTonka Buha
MentorLorena Perić (mentor)
MentorTomislav Ivanković (sumentor)
Član povjerenstvaTomislav Ivanković (predsjednik povjerenstva)
Član povjerenstvaJasna Lajtner (član povjerenstva)
Član povjerenstvaIvan Šulc (član povjerenstva)
Član povjerenstvaHana Fajković (član povjerenstva)
Član povjerenstvaZorica Petrinec (član povjerenstva)
Ustanova koja je dodijelila
akademski / stručni stupanj		Sveučilište u Zagrebu
Prirodoslovno-matematički fakultet
(Biološki odsjek)
Zagreb
Datum i država obrane2021-09-30, Hrvatska
Znanstveno / umjetničko
područje, polje i grana		PRIRODNE ZNANOSTI
Biologija
Sažetak
Rod Vibrio sadrži važne patogene školjkaša i drugih beskralješnjaka, riba i ljudi. Kako bi se očuvalo njihovo zdravlje bitna je njihova identifikacija do razine vrste. Cilj ovog istraživanja je bio identificirati odabrane Vibrio uzorke do razine vrste, odrediti filogenetske odnose i utvrditi sličnosti, tj. razlike u strukturi zajednica Vibrio bakterija između akvakulture školjkaša Limskog kanala i Malostonskog zaljeva. Analizirani su uzorci morske vode, sedimenta kao i tkiva školjkaša mediteranske dagnje (Mytilus galloprovincialis) i europske plosnate kamenice (Ostrea edulis). Metodom lančane reakcije polimerazom (PCR) ciljane su različite kodirajuće regije šest konstitutivno eksprimiranih gena (engl. housekeeping genes) i 16S rRNA. Uzorci su poslani na sekvenciranje nakon čega je provedena metoda multilokusnog sravnjivanja sljedova (MLSA). Za filogenetsku analizu korištene su metode najveće vjerojatnosti i susjednog sparivanja. Eksperimentalni uzorci unutar Harveyi podskupine su se razlučili do razine vrste, a unutar Splendidus podskupine do razine grupacije. Na području uzgajališta školjkaša Limski kanal identificirano je šest vrsta te pet Splendidus grupacija, dok je na području uzgajališta školjkaša Malostonski zaljev identificirano pet vrsta i šest Splendidus grupacija. Dokazana je prisutnost više patogenih i uvjetno patogenih Vibrio vrsta za na području istočnog Jadrana.
Sažetak (engleski)
The genus Vibrio consists of important shellfish and other invertebrate, fish and human pathogens. In order to preserve their health, identification to species level is essential. The aim of this study was to identify selected Vibrio samples to species level, to determine phylogenetic relationships and to determine similarities and differences in the structure of the Vibrio community between the shellfish aquaculture of the Lim Bay and Mali Ston Bay. Samples of seawater, sediments, tissues of Mediterranean mussel (Mytilus galloprovincialis) and European flat oyster (Ostrea edulis) were analyzed. Different coding regions of six housekeeping genes and 16S rRNA were targeted by the polymerase chain reaction (PCR). Samples were sent for sequencing after which a multilocus sequence alignment (MLSA) was performed. For phylogenetic analysis two methods were used: Maximum likelihood and Neighbour-joining. Experimental samples within the Harvey clade were identified to the species level while experimental samples within the Splendidus clade to the grouping level. In Lim Bay, six species and five Splendidus groups have been identified, while five species and six Splendidus groups in Mali Ston Bay. The presence of several pathogenic and conditionally pathogenic Vibrio species in the eastern Adriatic has been proven.
Ključne riječi
Ključne riječi (engleski)
Jezikhrvatski
URN:NBNurn:nbn:hr:217:821214
Studijski programNaziv: Znanosti o okolišu
Vrsta studija: sveučilišni
Stupanj studija: preddiplomski
Akademski / stručni naziv: sveučilišni/a prvostupnik/prvostupnica (baccalaureus/baccalaurea) struke znanosti o okolišu (univ. bacc. oecol.)
Vrsta resursaTekst
Način izrade datotekeIzvorno digitalna
Prava pristupaOtvoreni pristup
Datum isteka embarga: 2022-09-30
Uvjeti korištenjaIkona licence Zaštićeno autorskim pravom.
Datum i vrijeme pohrane2021-10-08 10:32:57